235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1097 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  53.27 
 
 
281 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3379  Ion transport 2  62.12 
 
 
146 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0913858 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5570  Ion transport 2 domain protein  52.83 
 
 
277 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1119  Ion transport 2 domain-containing protein  51.06 
 
 
279 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  32.65 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  30.16 
 
 
241 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  32.56 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  35.92 
 
 
244 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  34.06 
 
 
244 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  29.21 
 
 
330 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  33.66 
 
 
262 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  36.26 
 
 
280 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  30.34 
 
 
334 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  30.34 
 
 
334 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  35.29 
 
 
517 aa  61.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  30.34 
 
 
330 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  30.34 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
260 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  30.34 
 
 
330 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  30.7 
 
 
269 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  36.73 
 
 
385 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  30.34 
 
 
337 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  36.56 
 
 
251 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  35.35 
 
 
260 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  29.21 
 
 
330 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.21 
 
 
330 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  35.35 
 
 
260 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  31.86 
 
 
280 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
268 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  30.21 
 
 
268 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  27.34 
 
 
274 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  29.57 
 
 
328 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  26.32 
 
 
276 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  26.79 
 
 
270 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 
274 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  24.51 
 
 
272 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  35.9 
 
 
241 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
274 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
274 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  36.46 
 
 
255 aa  54.7  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
274 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  32.88 
 
 
274 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  34.62 
 
 
331 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  30.77 
 
 
231 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  35.23 
 
 
271 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
274 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  26.47 
 
 
253 aa  53.9  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  36.99 
 
 
405 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
274 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
274 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  31.33 
 
 
531 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.46 
 
 
408 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  29.09 
 
 
420 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  28.44 
 
 
269 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  29.09 
 
 
420 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  34.52 
 
 
409 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  29.67 
 
 
412 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  35.62 
 
 
282 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  31.19 
 
 
469 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  28.26 
 
 
292 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  25.17 
 
 
268 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  26.92 
 
 
257 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  43.86 
 
 
269 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  39.71 
 
 
269 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  35.71 
 
 
275 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  38.03 
 
 
302 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  31.43 
 
 
240 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  35.21 
 
 
303 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  29.41 
 
 
273 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  30.14 
 
 
273 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  29 
 
 
325 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  33.33 
 
 
264 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  40.35 
 
 
265 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  29.41 
 
 
276 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  31.58 
 
 
265 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.46 
 
 
409 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  29 
 
 
325 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  28.24 
 
 
272 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  32.38 
 
 
212 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  43.28 
 
 
388 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  40.35 
 
 
269 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  30 
 
 
265 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  35.59 
 
 
253 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  31.46 
 
 
357 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  27.96 
 
 
416 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  38.98 
 
 
231 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  30.93 
 
 
428 aa  48.9  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  27.35 
 
 
430 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  27.06 
 
 
417 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  25.47 
 
 
274 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  39.34 
 
 
316 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  29.17 
 
 
448 aa  48.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  27.06 
 
 
417 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  27.47 
 
 
419 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  32.47 
 
 
277 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  27.06 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  27.06 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  31.11 
 
 
282 aa  48.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>