146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1866 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  100 
 
 
281 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5570  Ion transport 2 domain protein  70.4 
 
 
277 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1119  Ion transport 2 domain-containing protein  63.41 
 
 
279 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  52.5 
 
 
140 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3379  Ion transport 2  51.06 
 
 
146 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0913858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  35.17 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  33.33 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  34.67 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  34.84 
 
 
280 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  26.56 
 
 
241 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 
241 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  28.1 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  32.56 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  25 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  34.31 
 
 
244 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  22.81 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  26.73 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  26.73 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  26.73 
 
 
274 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 
244 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  33.68 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  30.12 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  31.09 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  21.43 
 
 
272 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  27.17 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  35.21 
 
 
331 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  37.86 
 
 
260 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  26.63 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  37.36 
 
 
231 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  31.91 
 
 
469 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  30.09 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 
330 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  30.53 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  26.67 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  30.63 
 
 
517 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  28.97 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  37.33 
 
 
391 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  37.33 
 
 
391 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  30.51 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  38.46 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  26.47 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.51 
 
 
337 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  43.94 
 
 
231 aa  49.7  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  31.51 
 
 
146 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  28.04 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  25.16 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  41.67 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  31.51 
 
 
330 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  39.39 
 
 
391 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  31.51 
 
 
330 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  39.39 
 
 
391 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  39.39 
 
 
391 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  29.63 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  28.68 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  31.51 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  31.51 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  35.06 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  26.22 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  26.22 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  31.51 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  26.22 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  31.08 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  37.29 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  32.53 
 
 
331 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  29.32 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  25.71 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  27.2 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  25 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  33.33 
 
 
79 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  36.23 
 
 
331 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  30.61 
 
 
240 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  30.59 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  28.72 
 
 
277 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  29.79 
 
 
260 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  29.79 
 
 
260 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  24.05 
 
 
268 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  24.12 
 
 
270 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  27.12 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  29.36 
 
 
357 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  32.94 
 
 
409 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  30 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 
330 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  26.58 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  22.45 
 
 
131 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  30.07 
 
 
948 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  27.78 
 
 
260 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  30.34 
 
 
274 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  24.27 
 
 
265 aa  45.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  27.36 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  28.89 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  31.33 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  27.17 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  27.17 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  25.29 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  27.17 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  21.74 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  31.58 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  38 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  28.89 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>