More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3000 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
331 aa  670    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  57.45 
 
 
331 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  39.21 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  39.21 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  39.21 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  39.21 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  39.51 
 
 
331 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  39.51 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  39.51 
 
 
331 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  38.3 
 
 
331 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  38.91 
 
 
331 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  37.08 
 
 
331 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  39.82 
 
 
331 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  28.42 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0900  Ion transport 2 domain protein  30.04 
 
 
264 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.283884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  28.45 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  25.97 
 
 
513 aa  87.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  24.9 
 
 
430 aa  86.7  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  24.85 
 
 
330 aa  86.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  26.44 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  25.36 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  23.67 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  29.55 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.31 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  24.73 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.32 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  24.81 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.93 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  29.41 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  24.32 
 
 
477 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  23.13 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  23.53 
 
 
330 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.53 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.53 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.53 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  26.05 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  29.09 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  21.1 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.82 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  22.02 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  21.43 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  27.51 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  26.52 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  25.68 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  23.35 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  22.87 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.35 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.1 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.31 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  25.16 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  27.04 
 
 
438 aa  65.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  26.24 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.15 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  27.04 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  26.75 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  25.28 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  26.2 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  24.25 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.32 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0551  Ion transport 2 domain-containing protein  25.55 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43127  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  25.7 
 
 
395 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  44.9 
 
 
228 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  24.32 
 
 
531 aa  63.2  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  21.54 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  22.47 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  22.47 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  31.3 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  22.47 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 
341 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  28.41 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  28.68 
 
 
391 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.62 
 
 
324 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  24.05 
 
 
420 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  28.41 
 
 
391 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  43.59 
 
 
269 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  28.41 
 
 
391 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  24.05 
 
 
420 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  36.28 
 
 
272 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  22.87 
 
 
350 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  38.37 
 
 
277 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  38.14 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  46.03 
 
 
280 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  23.3 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  40.7 
 
 
283 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  38.46 
 
 
269 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  36.89 
 
 
274 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  32.56 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  41.33 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  39.53 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  39.39 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  22.48 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  34.91 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  38.37 
 
 
273 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>