More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2854 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  100 
 
 
331 aa  678    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  57.45 
 
 
331 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  43.47 
 
 
331 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  42.55 
 
 
331 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  42.55 
 
 
331 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  42.55 
 
 
331 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  42.55 
 
 
331 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  43.16 
 
 
331 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  42.86 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  43.16 
 
 
331 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  42.25 
 
 
331 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  41.95 
 
 
331 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  42.55 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  31.73 
 
 
344 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  27.3 
 
 
513 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.88 
 
 
335 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0900  Ion transport 2 domain protein  29.57 
 
 
264 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.283884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.02 
 
 
325 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  25.94 
 
 
347 aa  99.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.87 
 
 
335 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  25.18 
 
 
430 aa  91.3  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25.07 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  23.84 
 
 
337 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  22.42 
 
 
366 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  24.41 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.5 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.94 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  22.99 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.94 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  25.5 
 
 
330 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  25 
 
 
477 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  26.94 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25 
 
 
354 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.01 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.53 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  25.51 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  27.57 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.54 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  31.53 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.2 
 
 
531 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  25.11 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  22.02 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  25.25 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  24.17 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.78 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  29.74 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  24.92 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  24.75 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  22.8 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  24.58 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  24.62 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  23.78 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  21.39 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.84 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  29.48 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  24.09 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  25.83 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  24.15 
 
 
509 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  23.12 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  25.81 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  24.54 
 
 
517 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  24.41 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  26.34 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  20.93 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  26.34 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  25.86 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  24.07 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  24.35 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.74 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  22.22 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  23.41 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  23.53 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  24.56 
 
 
391 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
346 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  24.56 
 
 
391 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  21.01 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  20.36 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  24.17 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  23.33 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  25.17 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  24.23 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  37.65 
 
 
228 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  23.33 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  22.87 
 
 
370 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  24.67 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  24.91 
 
 
356 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  24.91 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  25.63 
 
 
351 aa  63.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0551  Ion transport 2 domain-containing protein  23.59 
 
 
367 aa  63.2  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43127  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  20.28 
 
 
359 aa  62.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  27.24 
 
 
396 aa  62.4  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  20.93 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  39.47 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  26 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  22.77 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  22.33 
 
 
364 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>