More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4160 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  81.43 
 
 		 351 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  80.4 
 
 		 350 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  80.4 
 
 		 350 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  71.06 
 
 		 350 aa  511  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  70.09 
 
 		 350 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  60.36 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  46.23 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  47.44 
 
 		 371 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  42.99 
 
 		 332 aa  298  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  42.9 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  46.13 
 
 		 347 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  44.27 
 
 		 331 aa  295  7e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  44.12 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  41.39 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  41.38 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  38.02 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  38.02 
 
 		 356 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  39.94 
 
 		 354 aa  249  7e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  41.21 
 
 		 362 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  41.1 
 
 		 350 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  38.89 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  39.17 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  39.33 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  38.91 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  37.88 
 
 		 335 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  37.91 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  36.16 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  37.54 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  36.61 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  37.2 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  37.2 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  37.2 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  36.01 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  37.2 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  36.89 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  37.91 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  34.15 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  41.09 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  33.84 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  37.85 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  36.25 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  36.81 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  32.93 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  32.12 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  31.63 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  34.66 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  33.33 
 
 		 352 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  33.02 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  30.41 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  35 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  31.68 
 
 		 509 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  32.36 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  32.72 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  33.33 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  33.33 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  33.33 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  32.8 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  33.43 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  30.65 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  32.11 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  32.93 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  33.13 
 
 		 346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  32.81 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  28.36 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  28.53 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.99 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  25.45 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  26.47 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25.23 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  26.78 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  29.02 
 
 		 531 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  32.52 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.17 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  37.71 
 
 		 182 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  38.13 
 
 		 146 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.78 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  29.88 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  29.23 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  26.63 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  26.83 
 
 		 563 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  26.28 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  31.18 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  25.53 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  25.53 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 		 366 aa  99.4  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  25.76 
 
 		 575 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 		 251 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  25.44 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  24.41 
 
 		 413 aa  95.9  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  25.29 
 
 		 546 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2167  TrkA-N domain protein  28.12 
 
 		 232 aa  95.5  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  24.23 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>