More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0556 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  689    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  41.44 
 
 
332 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  42.07 
 
 
332 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  38.82 
 
 
339 aa  240  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  35.03 
 
 
351 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  34.64 
 
 
350 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  32.23 
 
 
350 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  33.84 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  35.94 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  33.03 
 
 
337 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  32.34 
 
 
350 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  32.34 
 
 
350 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  34.53 
 
 
335 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  32.93 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  30.97 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  34.24 
 
 
325 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  31.97 
 
 
333 aa  192  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
330 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  31.5 
 
 
346 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  31.6 
 
 
350 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.54 
 
 
332 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  30 
 
 
338 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  35.47 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.65 
 
 
350 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  30.9 
 
 
357 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  28.13 
 
 
346 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.12 
 
 
347 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28.44 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28.44 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  28.44 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28.44 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  28.44 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  29.47 
 
 
336 aa  172  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 
355 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  30.03 
 
 
371 aa  172  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.77 
 
 
341 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.84 
 
 
337 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  31.33 
 
 
356 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  29.68 
 
 
384 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  28.61 
 
 
345 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  31.33 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  30.24 
 
 
335 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.64 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.04 
 
 
335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
368 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  26.97 
 
 
337 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  27.33 
 
 
335 aa  153  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  31.27 
 
 
341 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  27.03 
 
 
346 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.25 
 
 
341 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  27.02 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  27.27 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  27.27 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  27.27 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  26.23 
 
 
509 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  27.83 
 
 
351 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  25.14 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  27.9 
 
 
352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  26.77 
 
 
352 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  27.27 
 
 
359 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  23.85 
 
 
378 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  26.56 
 
 
351 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  23.89 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  23.71 
 
 
335 aa  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  23.67 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  24.46 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  24.26 
 
 
375 aa  113  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  25.14 
 
 
397 aa  112  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  27.08 
 
 
346 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  27.08 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  22.25 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  28.98 
 
 
182 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  36.16 
 
 
206 aa  96.7  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  27.59 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.3 
 
 
531 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  27.33 
 
 
366 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  26.14 
 
 
366 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  28.76 
 
 
215 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  21.43 
 
 
563 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  24.17 
 
 
662 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 
388 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  24.58 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  29.41 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  23.08 
 
 
583 aa  83.2  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  24.12 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  26.34 
 
 
227 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  25.08 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  22.67 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  23.26 
 
 
771 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  23.89 
 
 
546 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  25.08 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
620 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  25.08 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  25.08 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  24.14 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  24.18 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>