191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01339 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  100 
 
 
351 aa  726    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  60.34 
 
 
349 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  42.9 
 
 
347 aa  299  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  42.61 
 
 
347 aa  298  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  34.28 
 
 
354 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  33.53 
 
 
344 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  32.95 
 
 
351 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  33.44 
 
 
341 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02186  voltage-gated ion channel superfamily protein  30.22 
 
 
346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  29.94 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  23.99 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  21.85 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  24.58 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  24.83 
 
 
359 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  25.66 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  22.67 
 
 
513 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  25.22 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  23.51 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  23.56 
 
 
347 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  27.51 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  27.62 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  20.25 
 
 
350 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  25.22 
 
 
331 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  24.78 
 
 
331 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  28.49 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  24.29 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  24.29 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  25.63 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  24.29 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  24.23 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  25.22 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  26.52 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  24.78 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  24.78 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  24.78 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  24.78 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  25.66 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  26.62 
 
 
399 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  22.73 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  26.77 
 
 
393 aa  56.6  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  23.73 
 
 
430 aa  56.6  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  24.86 
 
 
355 aa  56.2  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  36.46 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  22.51 
 
 
366 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  22.61 
 
 
477 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.44 
 
 
341 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  22.85 
 
 
370 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  53.66 
 
 
517 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26360  K+ transport system, NAD-binding component  24.65 
 
 
497 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.427591  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  22.67 
 
 
341 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  48.28 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  25.81 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  31.11 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  31.11 
 
 
364 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  23.26 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  36.46 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  28.76 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  22.16 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  43.75 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.33 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  39.24 
 
 
283 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  34.12 
 
 
252 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  45.28 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  27.66 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  31.11 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  31.11 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  32.58 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  31.11 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  21.96 
 
 
350 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  32.58 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  22.17 
 
 
345 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  22.08 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  25.2 
 
 
335 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  32.58 
 
 
334 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  32.58 
 
 
334 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  46.55 
 
 
231 aa  49.3  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  38.78 
 
 
330 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8791  hypothetical protein  21.45 
 
 
621 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  24.06 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  23.53 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  25.32 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  24.06 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  21.52 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  39.68 
 
 
268 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  38.71 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  24.06 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  22.43 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  21.59 
 
 
569 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  24.06 
 
 
391 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  36.51 
 
 
244 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  50 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  44.64 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  45.83 
 
 
79 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  44.26 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  26.4 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  29.67 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>