129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003909 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  84.73 
 
 		 347 aa  634    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  100 
 
 		 347 aa  716    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  46.57 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  42.9 
 
 		 351 aa  299  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  37.11 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  33.53 
 
 		 351 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  32.44 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  32.7 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02186  voltage-gated ion channel superfamily protein  33.64 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  31.08 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  27.2 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  24.15 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  28.69 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  24.44 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  25.32 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  25.32 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  25.32 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  21.07 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.17 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  26.74 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  23.77 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  23.03 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  21.14 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  26.24 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  25.79 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  26.2 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0775  Ion transport 2 domain-containing protein  25.6 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  25.08 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  26.46 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  25.91 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  26.42 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  27.43 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  22.04 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  25.76 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  25.47 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  23.18 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  25.13 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  25.13 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  25.13 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  24.12 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  25.39 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  29.59 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  25.13 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  25.77 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.34 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  24.62 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  24.41 
 
 		 364 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  24.41 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  24.41 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  23.27 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28.74 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28.74 
 
 		 334 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  24.41 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  28.74 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  24.53 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28.74 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  24.06 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  24.41 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  24.06 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  24.06 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  26.86 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  22.47 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  24.87 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  24.06 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  24.61 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  24.06 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  24.06 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  24.06 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  23.79 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.63 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  23.94 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  24.71 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  23.89 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  23.08 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  23.32 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  24.52 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  23.51 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  27.04 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.36 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  45.28 
 
 		 241 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  31.67 
 
 		 146 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  39.51 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  29.52 
 
 		 280 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  23.08 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  23.99 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  25.75 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  23.46 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  23.46 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  21.91 
 
 		 324 aa  46.2  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>