More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4658 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  99.45 
 
 
364 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  92.29 
 
 
364 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  94.77 
 
 
386 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  100 
 
 
364 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  93.68 
 
 
364 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
364 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  94.21 
 
 
364 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  87.15 
 
 
369 aa  597  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  87.15 
 
 
369 aa  597  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  86.87 
 
 
369 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  87.15 
 
 
413 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  88.57 
 
 
326 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  88.57 
 
 
326 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  88.57 
 
 
326 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  88.57 
 
 
326 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  75.29 
 
 
368 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  40.3 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  40.31 
 
 
347 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  37.35 
 
 
355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  32.95 
 
 
366 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  34.45 
 
 
359 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  33.23 
 
 
356 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  32.1 
 
 
359 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 
339 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 
359 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  33.23 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  33.33 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  32.44 
 
 
366 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  33.43 
 
 
336 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  33 
 
 
355 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  31.99 
 
 
398 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  32.78 
 
 
370 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  34.07 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.3 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
335 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  29.08 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.63 
 
 
335 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.9 
 
 
332 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.62 
 
 
335 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.97 
 
 
341 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  27.82 
 
 
336 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.72 
 
 
337 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  27.59 
 
 
335 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.13 
 
 
350 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  27.1 
 
 
330 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.79 
 
 
334 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.79 
 
 
334 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.79 
 
 
330 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  27.17 
 
 
330 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  27.96 
 
 
357 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.34 
 
 
330 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 
350 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.9 
 
 
351 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 
351 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  25.89 
 
 
371 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  28.03 
 
 
354 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.52 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  27.83 
 
 
338 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.94 
 
 
346 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 
509 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  31.28 
 
 
346 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  31.07 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  29.75 
 
 
355 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
347 aa  96.3  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.58 
 
 
384 aa  96.3  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.28 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  23.26 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  26.9 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  26.59 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.34 
 
 
399 aa  94  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.61 
 
 
325 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  23.26 
 
 
350 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  32.2 
 
 
388 aa  93.6  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  27.88 
 
 
352 aa  93.2  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  26.55 
 
 
356 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.85 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  30.3 
 
 
531 aa  90.5  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  25.26 
 
 
333 aa  90.5  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 
345 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.29 
 
 
350 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  25.77 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  25.46 
 
 
351 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  25.46 
 
 
351 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  25.46 
 
 
351 aa  86.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  28.23 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.49 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.76 
 
 
393 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  25.2 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  23.71 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  23.88 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  26.42 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  23.88 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  23.81 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  31.1 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  27.97 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>