192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1223 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  100 
 
 		 349 aa  724    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  60.34 
 
 		 351 aa  454  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  46.57 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  43.71 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  35.09 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  34.88 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  31.42 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02186  voltage-gated ion channel superfamily protein  28.7 
 
 		 346 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  27.96 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.83 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  23.86 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  25.65 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  21.04 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  25.45 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  24.89 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  24.1 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  27.37 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  24.03 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  25.2 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  22.7 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  24.23 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  25.42 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  25.42 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  25.42 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  25.42 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  24.61 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  25.42 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  24.58 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  25 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  25.1 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  22.12 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  24.36 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  21.88 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  21.88 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  22.19 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  25.15 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.17 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  25.26 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  25.54 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  40 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  24.27 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  22.56 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  24.15 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  24 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  24.09 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  24.03 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  24.03 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  20.86 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  21.89 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.95 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  22.93 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  24.76 
 
 		 513 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  24.85 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  23 
 
 		 350 aa  52.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  20.97 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  23.15 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  23.66 
 
 		 477 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  39.76 
 
 		 264 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  24.04 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  29.25 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  54.17 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  22.56 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  38.55 
 
 		 268 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  24.59 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  39.76 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  35.8 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  54.17 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  54.17 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  54.17 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  54.17 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  54.17 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  54.17 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  54.17 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  54.17 
 
 		 274 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  37.35 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  23.53 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  23.08 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  23.08 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  20.93 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  23.08 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  22.6 
 
 		 413 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  23.79 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8791  hypothetical protein  22.4 
 
 		 621 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 269 aa  49.7  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.7 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  22.12 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 268 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25.7 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  22.12 
 
 		 369 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 		 454 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  22.12 
 
 		 369 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  30.95 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  22.12 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.7 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  22.12 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  22.88 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  28.72 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>