252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0605 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 326 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  27.3 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  24.7 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  27.95 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  41.67 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.65 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  28 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.16 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.43 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  29.75 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.53 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  42.86 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  19.88 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  20.6 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  24.55 
 
 		 513 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  46.15 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  46.58 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  26.13 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  18.94 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  26.69 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  25.98 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  24.32 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  38.46 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  41.25 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  24.32 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  41.25 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  24.32 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  49.12 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  24.32 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  24.32 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  24.32 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  24.32 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  24.32 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  41.77 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  24.69 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  24.32 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  24.69 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  24.69 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  37.18 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  18.54 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  19.73 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.72 
 
 		 325 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  19.25 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  39.33 
 
 		 231 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  28.62 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  23.86 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  19.25 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  19.25 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  28.1 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  23.48 
 
 		 614 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  19.25 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  19.25 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.71 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  46.55 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  22.62 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  23.17 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  24.88 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 251 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  35.11 
 
 		 279 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  38.98 
 
 		 380 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25.96 
 
 		 509 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  24.43 
 
 		 354 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  36.56 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.32 
 
 		 350 aa  52.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  23.92 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  24.29 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  45.45 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  19.57 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  40 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  40 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  40 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  38.75 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  26.09 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 		 626 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  26.21 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  26.09 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2566  TrkA-N domain protein  23.58 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  40 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  28.07 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  40 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  39.19 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  22.9 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  24.65 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  25.46 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  43.1 
 
 		 244 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  24.65 
 
 		 391 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  25.46 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  29.06 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  25.46 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  21.97 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  39.62 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>