277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2564 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
268 aa  530  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  84.09 
 
 
268 aa  421  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  42.42 
 
 
262 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  45.38 
 
 
260 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  45.38 
 
 
260 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  44.62 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  45.8 
 
 
260 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  46.7 
 
 
252 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  45.61 
 
 
251 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  41.37 
 
 
244 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  42.42 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  41.1 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  37.14 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  37.65 
 
 
280 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  31.14 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  30.73 
 
 
253 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  36.45 
 
 
241 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  30.45 
 
 
271 aa  99  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  31.91 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  36.81 
 
 
240 aa  94.4  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  27.24 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  27.54 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  29.49 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  26.78 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  28.02 
 
 
269 aa  86.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  30.9 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  30.9 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  30.9 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  28.77 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  28.64 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  31.13 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  27.37 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  30.39 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  29.05 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  29.05 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  29.05 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  30.81 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  29.52 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  30.37 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  29.78 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  33.15 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  27.69 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2007  Ion transport 2 domain protein  29.91 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867159 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  29.79 
 
 
517 aa  72  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  30.29 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  40.23 
 
 
430 aa  66.2  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  24.74 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  38.1 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  34.33 
 
 
409 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  33.07 
 
 
325 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  31.2 
 
 
531 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  32.28 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  35.59 
 
 
281 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  28.25 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  35.61 
 
 
419 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0462  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  29.94 
 
 
216 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  34.56 
 
 
405 aa  62.4  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 
509 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  30.71 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  34.65 
 
 
331 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  26.79 
 
 
328 aa  59.7  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  33.98 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  39.06 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  27.52 
 
 
277 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  36.73 
 
 
275 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  50.94 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  40.23 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.34 
 
 
408 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  30.51 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  33.65 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  32.58 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  33.65 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  33.65 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  34.62 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  33.65 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  35.16 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  29.93 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  29.55 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.06 
 
 
409 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  29.55 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  29.11 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  29.55 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  27.87 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  29.05 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  34.48 
 
 
331 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  39.66 
 
 
331 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  31.21 
 
 
273 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  31.25 
 
 
269 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  27.95 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  31.82 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  32.54 
 
 
355 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  30.95 
 
 
269 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  28.48 
 
 
271 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  29.81 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  32.22 
 
 
316 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  41.38 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  29.32 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  29.32 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  29.32 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>