229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1424 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
253 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  34.5 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  37.14 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  33.86 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  39.8 
 
 
260 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  35.63 
 
 
260 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  34.58 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  35 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  35 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  36.69 
 
 
252 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  35.03 
 
 
244 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  33.18 
 
 
269 aa  98.6  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  29.41 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  36.29 
 
 
255 aa  94  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  33.19 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  29.44 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  28 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  27.2 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  27.2 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  37.35 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  27.2 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  91.7  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  36.22 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  31.05 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  26.91 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  31.03 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  26.91 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  26.91 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  27.31 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  29.89 
 
 
280 aa  89.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  30.34 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  36.14 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  27.11 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  26.61 
 
 
241 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  35.92 
 
 
270 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  28.42 
 
 
276 aa  85.5  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  29.01 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  30.1 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  27.89 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  27.41 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  28.36 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  28.04 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  31.77 
 
 
231 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  31.58 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  33.8 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  34.48 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  28.51 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  32.56 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  25.5 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  34.51 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  33.81 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  25.12 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  26.89 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  32.69 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  28.02 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.65 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  28.35 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  32.11 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  31.47 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  29.27 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  31.82 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  27.13 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2007  Ion transport 2 domain protein  23.87 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  28.5 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  35.71 
 
 
517 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  29.27 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  26.73 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  28.78 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  28.38 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  33.06 
 
 
409 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  27.22 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  35.29 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  37.6 
 
 
419 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  41 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  24.71 
 
 
357 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  30.18 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  30.87 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  30.87 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  29.69 
 
 
405 aa  63.5  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  30.87 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  27.94 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  30.87 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  30.87 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  38.27 
 
 
331 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  25.55 
 
 
325 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  27.67 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  24.37 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  31.9 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  27.92 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  37 
 
 
289 aa  62.4  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  39.29 
 
 
385 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  25.44 
 
 
271 aa  62  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  26.07 
 
 
279 aa  62  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  28.86 
 
 
289 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  27.36 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  27.36 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  26.8 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  28.57 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  29.03 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  27.36 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>