242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004526 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  81.71 
 
 		 272 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  57.94 
 
 		 253 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  43.88 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  41.99 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  40.78 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  43.69 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  42.48 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  39.22 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 269 aa  188  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  37.45 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  37.45 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  37.6 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  38.13 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  38.26 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  39.82 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  33.59 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  32.61 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  33.33 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  32.46 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  29.44 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  32.32 
 
 		 269 aa  92  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  27.08 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  27.24 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3864  ion transporter  25.58 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.611066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  32.65 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  30.54 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  28.31 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  35.29 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  29.29 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  28.4 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  28.51 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  34.78 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  27.81 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  25.22 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  33.59 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  25.86 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  39.29 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  28.04 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  24.75 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  37.72 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  24.46 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  25.43 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  27.34 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  32.5 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  25.91 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  26.54 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  29.01 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  30.53 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  32.95 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  24.88 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  28.93 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  25.11 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  25.11 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  27.98 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  26.8 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  31.5 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  36.28 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  30.28 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  29.77 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  24.39 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  24.68 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  29.33 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  20.73 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  28.49 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  32.12 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  31.97 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  28.69 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  25.32 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  26.23 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  40.58 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  25.93 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  25.24 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  25 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  24.52 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  32.23 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  26.37 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  25 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  29.46 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  25.53 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  33.88 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  30.59 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  27.87 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  34.07 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  30.59 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  26.75 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  28.69 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  30.39 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  29.6 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  29.51 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  27.56 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  27.56 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>