217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0620 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  66.42 
 
 		 274 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  69.96 
 
 		 268 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  66.79 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  66.79 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  66.42 
 
 		 274 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  66.42 
 
 		 274 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  64.96 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  66.42 
 
 		 274 aa  367  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  65.2 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  65.06 
 
 		 269 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  66.16 
 
 		 265 aa  348  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  66.79 
 
 		 270 aa  347  9e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  64.1 
 
 		 273 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  64.21 
 
 		 276 aa  338  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  67.47 
 
 		 280 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  45.28 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  46.01 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  43.88 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  38.4 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  38.86 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  30.47 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3864  ion transporter  33.33 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.611066 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  32.3 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  33.01 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  29.49 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  26.21 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  26.51 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  30.39 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  29.41 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  31.15 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  24.38 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  25.2 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  26.75 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  26.12 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  25.79 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  26.24 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.29 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  27.27 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  22.43 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  30.88 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  28.78 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  28.02 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  31.62 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  30.14 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  26.86 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  26.86 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  26.86 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  26.67 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  31.82 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  26.86 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  24.68 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  29.19 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  25.71 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  25.85 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  27.14 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  25.24 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  30.14 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  22.01 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  23.85 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  27.13 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  26.8 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  24.3 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  33.62 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  35.59 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  23.85 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  29.27 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  25.71 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  25.71 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  27.31 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  25.71 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  25.71 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  26.67 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  25.93 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  28.86 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  25.11 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  23.94 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  24.11 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  24.15 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  21.64 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  25.88 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  26.09 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  25.58 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  25.71 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  30.59 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  25.24 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  27 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  23.38 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  28.36 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  24.15 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  30 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  23.7 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  27.03 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  24.15 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  32.71 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>