30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3864 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3864  ion transporter  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.611066 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  32.59 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  34.98 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  32.41 
 
 		 274 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  27.78 
 
 		 272 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  32.24 
 
 		 274 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  31.02 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  31.02 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  31.02 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  30.09 
 
 		 274 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  30.09 
 
 		 274 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  34.34 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  26.48 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  25.58 
 
 		 257 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  36.17 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  30.39 
 
 		 280 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  36.43 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  22.78 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  29.66 
 
 		 531 aa  55.5  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  26.03 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  24.6 
 
 		 277 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  23 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  22.27 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  25.96 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  27.85 
 
 		 517 aa  41.6  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>