240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3070 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
244 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  80.99 
 
 
244 aa  351  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  51.25 
 
 
260 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  50.83 
 
 
260 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  50.83 
 
 
260 aa  205  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  51.09 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  50.21 
 
 
252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  41.37 
 
 
268 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  49.56 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  44.31 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  44.21 
 
 
268 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  42.31 
 
 
262 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  30.38 
 
 
280 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  36.04 
 
 
253 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  34.03 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  32.52 
 
 
263 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  27.8 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  29.41 
 
 
276 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  37.82 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  28.09 
 
 
257 aa  89  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  36.67 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  27.54 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  29.12 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  28.5 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  29.7 
 
 
280 aa  85.5  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  26.09 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  29.77 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  28.51 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  28.89 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  28.1 
 
 
272 aa  82  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  30.41 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2007  Ion transport 2 domain protein  25.38 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  26.36 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  28.87 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  28.87 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  27.32 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  28.87 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  28.65 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  38.82 
 
 
517 aa  75.1  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  28.14 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  26.58 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  31.58 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  27.44 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  27.84 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  23.85 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  31.89 
 
 
279 aa  72  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  24.62 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  24.19 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  24.19 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  26.47 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  26.43 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  26.52 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  28.66 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  25.68 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  27.8 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 
531 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  37.5 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  26.79 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  24.12 
 
 
276 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  26.8 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  28.36 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  27.06 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0462  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  31.55 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  34.23 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  34.23 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  25.34 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  34.23 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  34.23 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  34.23 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  29.94 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  26.05 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  24.34 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  26.67 
 
 
276 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  25.11 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  41.54 
 
 
274 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  29.67 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  26.39 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  28.89 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  27.32 
 
 
298 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  28.24 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  37.38 
 
 
140 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  30 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  34.65 
 
 
419 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  24.6 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  24.6 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  26.19 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  32.52 
 
 
282 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  29.27 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  29.27 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  25.15 
 
 
513 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  29.27 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  28.81 
 
 
277 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  25.34 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  29.27 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  25.13 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  33.05 
 
 
292 aa  62  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  34.04 
 
 
428 aa  62  0.000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  27.93 
 
 
409 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>