174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0363 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  32.77 
 
 
241 aa  145  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  26.89 
 
 
269 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  26.58 
 
 
269 aa  79  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  26.97 
 
 
253 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  28.32 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  26.56 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  27.8 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  27.8 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  27.8 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  26.27 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  26.61 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  27.1 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  26.61 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  26.61 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  27.24 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  25.11 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  27.43 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  28.33 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.81 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  27.57 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  26.75 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  26.53 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  27.14 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  25.22 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  22.22 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  26.05 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  27.95 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  27.85 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  30.42 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0462  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  25.7 
 
 
216 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  27.16 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  28.77 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  26.32 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  24.7 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  26.72 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  25.19 
 
 
262 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  23.83 
 
 
273 aa  63.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  27.12 
 
 
228 aa  62.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  22.17 
 
 
260 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  25.82 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  24.64 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  27.93 
 
 
271 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  26.05 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  26.97 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  28.92 
 
 
263 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  26.7 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  23.56 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  30.73 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  21.23 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  21.23 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  26.34 
 
 
279 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  24.73 
 
 
276 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  24.56 
 
 
255 aa  59.7  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  26.36 
 
 
240 aa  59.3  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  23.66 
 
 
328 aa  59.3  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  25.41 
 
 
325 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  26.85 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  23.21 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  23.63 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  29.35 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  25.08 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  27.27 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  30.14 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  25.15 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  23.21 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.37 
 
 
408 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  26.26 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  26.19 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  23.21 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  23.21 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  26.53 
 
 
268 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  26.26 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  23.74 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  26.26 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  26.29 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  26.55 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  27.64 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  26.29 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  26.29 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  26.7 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  26.29 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  24.77 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  23.08 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  24 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  21.43 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  43.48 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  30.77 
 
 
344 aa  53.1  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  27.66 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  43.48 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  23.74 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  25.33 
 
 
263 aa  53.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  25 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  26.67 
 
 
277 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  26.8 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  26.32 
 
 
276 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  29.71 
 
 
277 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  28.26 
 
 
140 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  29.31 
 
 
282 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  31.65 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>