More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2438 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  869    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  28.67 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  27.02 
 
 		 477 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  28.52 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  28.52 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  28.52 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  28.52 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  28.52 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  25.13 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  27.6 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  27.92 
 
 		 331 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  27.27 
 
 		 331 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  27.92 
 
 		 331 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  24.1 
 
 		 331 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  29.6 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0551  Ion transport 2 domain-containing protein  26.42 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  24.92 
 
 		 513 aa  87  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  27.17 
 
 		 347 aa  87  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  24.9 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  27.08 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  24.36 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.81 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  27.85 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.85 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.02 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  29.72 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  25.94 
 
 		 335 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  24.07 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  28.42 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  39.05 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  36 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  23.01 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  24.21 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  27.24 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  24.21 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  24.21 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  24.21 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  24.21 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  24.21 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  24.21 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  24.21 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  24.21 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.34 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25.24 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 330 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  24.92 
 
 		 395 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  45.16 
 
 		 231 aa  67  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  24.39 
 
 		 332 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  24.72 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  40.23 
 
 		 268 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  38.68 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  40.24 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  22.57 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.75 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  25.51 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  24.35 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  34.18 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  34.88 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.18 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  39.08 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  26.55 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.08 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  25 
 
 		 335 aa  63.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  27.96 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.51 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  27.96 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  28.71 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  27.96 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  25.81 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  37.8 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  21.17 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  21.17 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  23.78 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  27.56 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  21.17 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  26.87 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  26.86 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.63 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.63 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.52 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0900  Ion transport 2 domain protein  29.66 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.283884 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.63 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.63 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.93 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  22.7 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  33.33 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  25.79 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  25.35 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  21.86 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  23.44 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  36.9 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>