More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3680 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
509 aa  1047    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  29.27 
 
 
531 aa  225  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  29.76 
 
 
517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  33.24 
 
 
351 aa  183  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  34.45 
 
 
332 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  31.68 
 
 
351 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  33.22 
 
 
350 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  32.57 
 
 
350 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  32.46 
 
 
350 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  32.25 
 
 
350 aa  177  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  34.17 
 
 
513 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  34.65 
 
 
354 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  31.99 
 
 
350 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  29.77 
 
 
337 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  33.44 
 
 
338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  29.12 
 
 
335 aa  159  9e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.24 
 
 
330 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  32.58 
 
 
352 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  30.03 
 
 
346 aa  157  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.57 
 
 
347 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.1 
 
 
325 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  30.07 
 
 
336 aa  155  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  32.56 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28.66 
 
 
334 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28.35 
 
 
334 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  32.66 
 
 
337 aa  152  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  28.04 
 
 
330 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  33.89 
 
 
331 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28.35 
 
 
330 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  31.56 
 
 
355 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  27.41 
 
 
330 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.81 
 
 
350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  30.03 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  31.66 
 
 
359 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  27.41 
 
 
330 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  32.4 
 
 
351 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
332 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 
333 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.13 
 
 
337 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 
332 aa  143  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  31.09 
 
 
405 aa  141  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  29.43 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  29.43 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  29.43 
 
 
351 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  29.43 
 
 
352 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.18 
 
 
341 aa  140  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  29 
 
 
356 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  29.39 
 
 
351 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  29 
 
 
356 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  28.14 
 
 
352 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  31.88 
 
 
345 aa  137  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.49 
 
 
335 aa  136  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 
384 aa  135  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.48 
 
 
371 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.83 
 
 
335 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  28.25 
 
 
357 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  25.9 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  26.23 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.25 
 
 
335 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  29.33 
 
 
341 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  27.42 
 
 
339 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  27.84 
 
 
355 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  28.06 
 
 
335 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  28.27 
 
 
376 aa  121  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 
368 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  30.29 
 
 
341 aa  113  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  27.74 
 
 
346 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  27.74 
 
 
346 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
397 aa  110  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  31.28 
 
 
388 aa  109  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  22.74 
 
 
375 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  27.95 
 
 
366 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  29.37 
 
 
277 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  25.5 
 
 
325 aa  103  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  25.17 
 
 
325 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  28.17 
 
 
344 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  25.34 
 
 
376 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  27.3 
 
 
311 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  30.09 
 
 
368 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.3 
 
 
395 aa  101  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  28.63 
 
 
228 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 
347 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  26 
 
 
378 aa  100  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  25.75 
 
 
347 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  30.93 
 
 
364 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 
408 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  26.62 
 
 
282 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  25.71 
 
 
420 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  25.71 
 
 
420 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  28.2 
 
 
265 aa  97.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  30.63 
 
 
364 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 
364 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  28.95 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  29.39 
 
 
364 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  26.38 
 
 
265 aa  95.1  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  28.3 
 
 
395 aa  95.1  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  26.72 
 
 
393 aa  94  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  21.99 
 
 
324 aa  94  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  29.31 
 
 
335 aa  93.2  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  22.8 
 
 
376 aa  93.2  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>