43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02186 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02186  voltage-gated ion channel superfamily protein  100 
 
 		 346 aa  693    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  37.76 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  35.09 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  29.08 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  35.82 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  33.64 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  30.22 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  33.76 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  28.7 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  26.1 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  26.3 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  25.35 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  22.18 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  22.81 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  22.67 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  25.54 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  25.42 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  24.5 
 
 		 347 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  24.18 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  25.56 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  29.82 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  32.97 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  24 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  28.82 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  24 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  24 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  22.42 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  23.76 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  23.2 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  23.2 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  23.2 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  23.2 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  23.08 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  23.2 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  23.89 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  22.52 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  21.94 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26360  K+ transport system, NAD-binding component  21.89 
 
 		 497 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.427591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  23.63 
 
 		 331 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  21.94 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  20 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  23.76 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  20.98 
 
 		 413 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>