More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2999 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  100 
 
 
388 aa  758    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  62.66 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  54.69 
 
 
399 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  60 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  58.77 
 
 
393 aa  388  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  41.05 
 
 
396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  33.33 
 
 
416 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  34.16 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  34.16 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  29.45 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  29.45 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  29.45 
 
 
391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  32.21 
 
 
391 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  34.33 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  34.33 
 
 
417 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  34.33 
 
 
417 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  34.33 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  34.33 
 
 
417 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  34.33 
 
 
417 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  34.33 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  34.33 
 
 
417 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  33.66 
 
 
391 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  33.66 
 
 
391 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  32.89 
 
 
391 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  33.22 
 
 
391 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  33.91 
 
 
417 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  30.84 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  30.84 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  31.27 
 
 
352 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  36.87 
 
 
337 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  37.07 
 
 
347 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  34.18 
 
 
350 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  31.14 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  31.92 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  33.18 
 
 
335 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  31.06 
 
 
351 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  31.71 
 
 
351 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  29.45 
 
 
355 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  31.8 
 
 
335 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  33.19 
 
 
330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  35.42 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  33.17 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  33.95 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  31.8 
 
 
335 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 
341 aa  113  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  32.3 
 
 
350 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  32.5 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  32.74 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  31.98 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.14 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  38.57 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  32.59 
 
 
337 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 
509 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  31.05 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  31.86 
 
 
330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  31.05 
 
 
356 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  32.29 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  32.29 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  32.29 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.14 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 
362 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  34.56 
 
 
333 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  31.71 
 
 
371 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  31 
 
 
335 aa  106  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 
350 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  33.47 
 
 
341 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  31.84 
 
 
347 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  33.47 
 
 
366 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  31.37 
 
 
352 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  34.48 
 
 
331 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.49 
 
 
332 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 
368 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.31 
 
 
332 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  30.46 
 
 
531 aa  100  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  33.02 
 
 
384 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  33.96 
 
 
345 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  29.11 
 
 
332 aa  99  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  32.35 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  25.85 
 
 
351 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  34.31 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.41 
 
 
366 aa  96.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  32.77 
 
 
542 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  29.03 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  26.83 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  26.83 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  26.83 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  29.03 
 
 
346 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  26.1 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  32.2 
 
 
364 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  32.2 
 
 
364 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  32.2 
 
 
364 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  33.18 
 
 
457 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  31.19 
 
 
346 aa  93.2  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  30.22 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  32.2 
 
 
386 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  31.82 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>