More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1528 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  707    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  70.18 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  61.88 
 
 		 346 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  51.35 
 
 		 371 aa  347  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  51.09 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  46.91 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  46.6 
 
 		 350 aa  299  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  46.13 
 
 		 351 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  44.73 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  44.06 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  44.19 
 
 		 350 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  42.59 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  42.53 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  45.76 
 
 		 350 aa  275  9e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  40.82 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  38.51 
 
 		 330 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  42.95 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  36.92 
 
 		 354 aa  230  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  38.96 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  36.02 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  37.88 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  35.8 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  35.03 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  36.11 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  35.03 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  36.11 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  39.61 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  35.26 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  36.34 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  36.28 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  33.97 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  36.19 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  36.19 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  36.31 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  34.43 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  34.43 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  34.73 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  34.44 
 
 		 341 aa  207  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  34.89 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  38.89 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  34.58 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  34.69 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  34.98 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  34.37 
 
 		 355 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  33.44 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  34.38 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  33.12 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  34.57 
 
 		 351 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  34.94 
 
 		 351 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  34.94 
 
 		 351 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  34.94 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  33.53 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  34.98 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  33.44 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  35.91 
 
 		 352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  36.78 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  38.46 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  35 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  35.28 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  28.12 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  41.04 
 
 		 346 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  41.04 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  38.52 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  29.57 
 
 		 509 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  29.07 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.97 
 
 		 531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  25.15 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  27.67 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.79 
 
 		 397 aa  126  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  37.07 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  25.66 
 
 		 376 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  31.76 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  35.75 
 
 		 182 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  30.07 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  26.3 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  26.3 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  26.3 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  28.87 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  26.69 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 369 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  26.94 
 
 		 369 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 369 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  26.94 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  26.87 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  26.94 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25.32 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  25.38 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  25.77 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  25.77 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  27.33 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  31 
 
 		 546 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  25.57 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  24.3 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.07 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>