More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2680 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 397 aa  810    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  27.87 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  29.36 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  29.17 
 
 		 335 aa  158  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  33.65 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  30.42 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  27.93 
 
 		 375 aa  153  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  28.36 
 
 		 351 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.97 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  29.45 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  30.4 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  27.25 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  27.25 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  29.68 
 
 		 354 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  27.25 
 
 		 334 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  26.95 
 
 		 330 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  27.98 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  29.87 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  28.17 
 
 		 333 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.39 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.35 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.32 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.35 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  31.29 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.35 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  26.8 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  28.86 
 
 		 345 aa  137  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  28.33 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  28.26 
 
 		 337 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.81 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  28.01 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.25 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  28.01 
 
 		 356 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26.41 
 
 		 350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  26.41 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.31 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.31 
 
 		 336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  30.4 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  27.62 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  30.67 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.98 
 
 		 350 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.79 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.69 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  27.6 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 325 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  25.14 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 509 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.12 
 
 		 351 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.38 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.38 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  25.43 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.38 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  29.01 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  25 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  30.72 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  25.36 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  26.41 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 339 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  23.53 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  25.42 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  24.79 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 		 562 aa  93.2  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.01 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  33.85 
 
 		 146 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  24.54 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  23.24 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25.46 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  23.71 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  19.73 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  26.14 
 
 		 546 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  26.42 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 544 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  24.38 
 
 		 567 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  26.29 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  28.78 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  27.53 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  25.88 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  26.42 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  26.42 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  22.54 
 
 		 614 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2004  TrkA-N domain protein  25.47 
 
 		 579 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.88767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  30.15 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  22.93 
 
 		 563 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  26.77 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  23.45 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  24.23 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  25.63 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  25.76 
 
 		 583 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  24.44 
 
 		 564 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>