More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1187 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  100 
 
 
541 aa  1071    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  48.43 
 
 
544 aa  483  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  44.34 
 
 
542 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  42.86 
 
 
544 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  39.63 
 
 
548 aa  382  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  36.33 
 
 
562 aa  309  6.999999999999999e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  35.52 
 
 
551 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  28.49 
 
 
567 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 
564 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  28.01 
 
 
569 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  28.42 
 
 
568 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  32.96 
 
 
457 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  28.97 
 
 
549 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  29.04 
 
 
567 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  27.76 
 
 
614 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  28.06 
 
 
576 aa  163  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  24.55 
 
 
568 aa  148  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
293 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  30.12 
 
 
347 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  35.32 
 
 
225 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 
341 aa  109  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.71 
 
 
346 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.32 
 
 
347 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  24.92 
 
 
330 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 
351 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.85 
 
 
346 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  24.08 
 
 
330 aa  97.4  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.27 
 
 
351 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.48 
 
 
371 aa  96.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.96 
 
 
337 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.35 
 
 
332 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 
350 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  24.76 
 
 
313 aa  94.7  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  24.21 
 
 
335 aa  94.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  27.58 
 
 
345 aa  94  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.46 
 
 
351 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  25.97 
 
 
350 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  23.99 
 
 
351 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  23.99 
 
 
351 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  25.97 
 
 
350 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.43 
 
 
350 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  22.87 
 
 
335 aa  91.3  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.68 
 
 
351 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.61 
 
 
334 aa  90.9  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  22.87 
 
 
335 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.28 
 
 
330 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.28 
 
 
334 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.63 
 
 
325 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  23.08 
 
 
330 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  25.95 
 
 
336 aa  89.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  28.03 
 
 
350 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  22.41 
 
 
330 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  26.71 
 
 
509 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.75 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  23.62 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  27.85 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  27.68 
 
 
333 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 
332 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  25.97 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  32.43 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  28.76 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  26.71 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  26.91 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.2 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  25.41 
 
 
206 aa  77  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25 
 
 
355 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  25.75 
 
 
337 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 
341 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 
335 aa  76.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  31.75 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  25.34 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  24.66 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  24.66 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  25.82 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 
674 aa  73.9  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 
693 aa  73.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  27.44 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.71 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  31.52 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.78 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  29.14 
 
 
366 aa  73.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.15 
 
 
352 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
668 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  32.93 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  32.93 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  32.93 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  26.92 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  24.19 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.26 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  32.45 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  25.35 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  31.92 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  25.3 
 
 
636 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  29.77 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>