More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0117 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  100 
 
 
345 aa  704    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  37.31 
 
 
350 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  37.88 
 
 
351 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  36.25 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  36.96 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  35.17 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  35.76 
 
 
350 aa  210  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  35.76 
 
 
350 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  35.15 
 
 
332 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  34.58 
 
 
347 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  35.33 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  37.11 
 
 
331 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  33.54 
 
 
346 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.71 
 
 
346 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  34.39 
 
 
371 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  32.61 
 
 
362 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  34.57 
 
 
333 aa  189  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  35.13 
 
 
350 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  34.15 
 
 
334 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  34.15 
 
 
330 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  34.15 
 
 
330 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  33.85 
 
 
334 aa  186  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  31.35 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  32.62 
 
 
330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  33.23 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.23 
 
 
330 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  33.13 
 
 
337 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  31.85 
 
 
341 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  30.87 
 
 
355 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  32.36 
 
 
356 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  32.36 
 
 
356 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
384 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  28.61 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  34.39 
 
 
335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  32 
 
 
338 aa  172  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  31.21 
 
 
341 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  31.95 
 
 
336 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  32.61 
 
 
351 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 
337 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  32.61 
 
 
351 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  32.61 
 
 
351 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  36.45 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  31.83 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  29.47 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.31 
 
 
335 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 
355 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 
335 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 
339 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 
352 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 
346 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 
335 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  32.44 
 
 
351 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  32.42 
 
 
352 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 
332 aa  153  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  29.08 
 
 
368 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  33.98 
 
 
359 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  28.35 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  35.63 
 
 
352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  31.88 
 
 
509 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  28.86 
 
 
397 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  29.08 
 
 
357 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  33.59 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  34.8 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.75 
 
 
376 aa  125  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  33.21 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  33.21 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  26.53 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  24.12 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  36.15 
 
 
531 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  23.86 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  29.75 
 
 
256 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  24.69 
 
 
324 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  25.32 
 
 
378 aa  106  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  23.13 
 
 
375 aa  106  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  30.13 
 
 
366 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 
359 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  28.86 
 
 
359 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  28.86 
 
 
359 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  28.86 
 
 
359 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 
339 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.9 
 
 
350 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 
341 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  29.68 
 
 
359 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.96 
 
 
388 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  35.8 
 
 
182 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  29.01 
 
 
562 aa  99.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 
345 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  30.23 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  30 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  30.23 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  30.23 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 
417 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  30.23 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  30.23 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  34.2 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  30.23 
 
 
417 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  30.23 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  32.24 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  29.77 
 
 
417 aa  95.9  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>