188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1346 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  93.43 
 
 
335 aa  655    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
376 aa  762    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  76.6 
 
 
376 aa  614  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  64.1 
 
 
376 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  64.36 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  57.67 
 
 
378 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 
397 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.89 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.04 
 
 
338 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.85 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  27.11 
 
 
350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  29.6 
 
 
335 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.54 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26.8 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  26.23 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.54 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  26.8 
 
 
350 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.47 
 
 
351 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.54 
 
 
334 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  24.7 
 
 
330 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.18 
 
 
354 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  28.85 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  25.82 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.73 
 
 
337 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.54 
 
 
351 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 
362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  25.3 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 
356 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 
356 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.66 
 
 
332 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.93 
 
 
341 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  26.92 
 
 
345 aa  122  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  28.27 
 
 
509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.89 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25 
 
 
346 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.62 
 
 
325 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  25.76 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.92 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.92 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.92 
 
 
351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  23.98 
 
 
336 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  27.44 
 
 
352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.39 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  31.02 
 
 
341 aa  113  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  24.56 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  24.2 
 
 
357 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  24.04 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.86 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.82 
 
 
351 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25.38 
 
 
347 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  25 
 
 
350 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  26.46 
 
 
351 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  24.47 
 
 
332 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  23.89 
 
 
352 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  24.09 
 
 
332 aa  100  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  22.78 
 
 
335 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  22.78 
 
 
335 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  23.26 
 
 
359 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  23.56 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  27.24 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  23.2 
 
 
335 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  32.35 
 
 
146 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  21.6 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  25.43 
 
 
339 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.43 
 
 
368 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25.53 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  23.99 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  23.99 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  24.33 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.7 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  24.8 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  24.8 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  24.8 
 
 
402 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  24.8 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  24.8 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  24.8 
 
 
402 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  24.8 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  24.8 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  24.8 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  22.73 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  25.24 
 
 
544 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  21.29 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  25.86 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  25.86 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  21.26 
 
 
568 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  25.86 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  23.98 
 
 
562 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  23.05 
 
 
395 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  23.36 
 
 
541 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  23.86 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  23.86 
 
 
391 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  24.42 
 
 
391 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 
438 aa  59.7  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  20.94 
 
 
517 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  25.09 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  24.14 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>