More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06531 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  100 
 
 		 359 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  69.73 
 
 		 352 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  69.12 
 
 		 352 aa  464  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  69.71 
 
 		 351 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  58.26 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  58.26 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  58.86 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  58.26 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  59.57 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  59.57 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  41.96 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  43.38 
 
 		 338 aa  248  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  41.92 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  41.56 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  41.56 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  42.77 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  43.81 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  33.02 
 
 		 351 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  34.07 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  33.75 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  36.78 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  33.13 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  33.75 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  33.44 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  32.13 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  35.56 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  33.13 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  34.97 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  30.98 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  31.33 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  29.66 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  31 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  31.6 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  31.79 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 		 335 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.22 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 		 335 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.69 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  31.72 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  33.12 
 
 		 509 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  29.38 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  29.38 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  35.98 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  29.38 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  29.06 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  28.93 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  35.09 
 
 		 331 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  32.66 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  30.18 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  30.4 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  29.36 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  28.2 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.86 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  30.95 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  28.61 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  27.91 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  32.63 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  28.49 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  23.87 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  23.42 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  21.94 
 
 		 531 aa  102  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  21.23 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  26.85 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  29.89 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  23.1 
 
 		 376 aa  96.7  6e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 		 339 aa  96.3  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  26.69 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  27.27 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  27.15 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30.24 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 335 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  34.78 
 
 		 256 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  32.96 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  26.47 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 		 398 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  21.01 
 
 		 376 aa  89.7  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  25.44 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  28.43 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  26.52 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  28.57 
 
 		 402 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  28.43 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  28.57 
 
 		 402 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  28.43 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  28.43 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  28.43 
 
 		 417 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>