More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0368 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  100 
 
 
356 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  99.72 
 
 
356 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  74.43 
 
 
355 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  65.07 
 
 
354 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  65.82 
 
 
362 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  65.38 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  53.96 
 
 
341 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  41.07 
 
 
350 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  41.07 
 
 
350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  38.98 
 
 
350 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  38.02 
 
 
351 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  38.12 
 
 
350 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  39.81 
 
 
351 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  41.92 
 
 
359 aa  235  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  41.49 
 
 
352 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  42.41 
 
 
351 aa  225  9e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  36.76 
 
 
371 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  37.17 
 
 
346 aa  222  9e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  41.96 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  38.66 
 
 
351 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  39.88 
 
 
351 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  39.88 
 
 
351 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  39.88 
 
 
351 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  35.15 
 
 
337 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  36.31 
 
 
347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  36.36 
 
 
332 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  34.94 
 
 
332 aa  209  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  35.6 
 
 
332 aa  207  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  37.58 
 
 
331 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  33.33 
 
 
335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  35.38 
 
 
350 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  35.24 
 
 
346 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  37.42 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  34.28 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  37.42 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  34.08 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  34.28 
 
 
335 aa  195  9e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 
335 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 
330 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  31.93 
 
 
330 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 
325 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  33.87 
 
 
350 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  32.21 
 
 
341 aa  187  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  31.9 
 
 
330 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  31.93 
 
 
330 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.95 
 
 
337 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  31.93 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  31.93 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  33.76 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  31.93 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  32.34 
 
 
355 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  32.8 
 
 
352 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  33.03 
 
 
384 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  32.36 
 
 
345 aa  172  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  33.44 
 
 
368 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  30.45 
 
 
346 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  35.58 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  31.63 
 
 
339 aa  165  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  30.72 
 
 
335 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  28.97 
 
 
337 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  29.5 
 
 
357 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  28.4 
 
 
346 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  28.17 
 
 
509 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  34.38 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.42 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  27.46 
 
 
376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  26.65 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.92 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  31.17 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  26.25 
 
 
378 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  25.94 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  24.71 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30.95 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  32.19 
 
 
393 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.55 
 
 
395 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  32.97 
 
 
182 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  28.45 
 
 
256 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.39 
 
 
531 aa  99.8  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 
368 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  26.55 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  32.76 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  28.06 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  22.16 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  26.9 
 
 
364 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  27.82 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  26.9 
 
 
364 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  27.82 
 
 
364 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  27.44 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  25.61 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  27.53 
 
 
359 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  25.4 
 
 
399 aa  89.4  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  31.62 
 
 
146 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  27.99 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  27.99 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  27.99 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2167  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 
232 aa  87.4  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>