More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0800 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 331 aa  673    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  56.83 
 
 		 371 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  51.09 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  52.85 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  50 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  44.69 
 
 		 350 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  44.27 
 
 		 351 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  44.38 
 
 		 350 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  44.14 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  43.67 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  41.97 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  41.82 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  42.81 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  40.19 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  40.25 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  38.94 
 
 		 354 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  39.06 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  39.74 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  35.94 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  38.36 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  40 
 
 		 350 aa  221  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  36.94 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  37.3 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 		 335 aa  215  7e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  36.94 
 
 		 356 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  34.78 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  36.94 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  37.22 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  33.75 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  37.11 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  33.97 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  37.11 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  31.96 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  34.47 
 
 		 339 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  31.65 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  34.7 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  31.33 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  31.79 
 
 		 355 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  33.13 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  30.7 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  30.38 
 
 		 334 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  30.38 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  30.38 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  30.96 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  33.88 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  30.89 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  33.44 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  33.96 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  34.58 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  33.89 
 
 		 509 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  29.32 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  32.05 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  29.32 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  28.75 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  34.78 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  29.32 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  29.54 
 
 		 324 aa  155  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  33.44 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  33.44 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  29.48 
 
 		 346 aa  152  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  31.29 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.53 
 
 		 366 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  30.67 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  26.28 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  25.79 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.67 
 
 		 531 aa  129  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25.61 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  33.73 
 
 		 395 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  25.76 
 
 		 376 aa  122  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  25.73 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  30.51 
 
 		 182 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  34.48 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  28.45 
 
 		 256 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  32.67 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  22.04 
 
 		 375 aa  105  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  30 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  30 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  30 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  30 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  30 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  30 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  30 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  30.67 
 
 		 217 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  29.52 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.69 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  26.96 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.7 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  30.3 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  26.43 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  27.11 
 
 		 583 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  26.4 
 
 		 564 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  25.2 
 
 		 364 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  25.2 
 
 		 364 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  25.2 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>