256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2537 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  100 
 
 		 438 aa  869    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  100 
 
 		 408 aa  802    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  49.36 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  49.36 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  44.27 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  47.46 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  46.5 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  46.91 
 
 		 391 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  46.91 
 
 		 391 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  46.91 
 
 		 391 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  38.62 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  38.62 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  39.37 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  38.62 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  38.62 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  38.62 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  38.62 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  38.62 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  39.37 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  34.65 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  34.65 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  34.65 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.79 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.74 
 
 		 393 aa  116  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.51 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.08 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.02 
 
 		 325 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  31.15 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  29 
 
 		 330 aa  93.6  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  29.5 
 
 		 330 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  29.13 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 		 509 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  29.36 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  28.69 
 
 		 352 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  29 
 
 		 330 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.71 
 
 		 338 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  29.29 
 
 		 337 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  28 
 
 		 330 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28 
 
 		 334 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  28 
 
 		 330 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  28.21 
 
 		 350 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  25.49 
 
 		 336 aa  87  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25.98 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  27.75 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  30.26 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25.56 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.42 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.6 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  30.1 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  27.49 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  28.74 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  31.47 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  28.92 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.36 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  28.52 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  26.89 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  26.61 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.87 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.34 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  29.81 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.87 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  28.16 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.23 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  29.05 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  25.33 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.32 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  28 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.26 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.23 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  26.55 
 
 		 350 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  28.51 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  25.55 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  22.28 
 
 		 351 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  22.28 
 
 		 351 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  28.06 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  22.28 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  22.28 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>