More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1744 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  100 
 
 
368 aa  748    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  50.28 
 
 
384 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  40.43 
 
 
346 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  42.25 
 
 
347 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  41.43 
 
 
366 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  38.24 
 
 
350 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  36.34 
 
 
347 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  38.01 
 
 
351 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  37.85 
 
 
351 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  44.84 
 
 
256 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  36.14 
 
 
350 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  35.29 
 
 
350 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  35.29 
 
 
350 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 
346 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  35.29 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  35.44 
 
 
337 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  34.57 
 
 
346 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  35.07 
 
 
362 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.97 
 
 
332 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  34.93 
 
 
341 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  34.7 
 
 
331 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  33.63 
 
 
371 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  35.29 
 
 
338 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  31.2 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  33.44 
 
 
356 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  33.44 
 
 
356 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  31.08 
 
 
335 aa  176  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  32.67 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.99 
 
 
337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  34.35 
 
 
341 aa  166  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  35.95 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  31.87 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  31.38 
 
 
330 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32 
 
 
330 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  31.08 
 
 
330 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  31.08 
 
 
334 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  31.08 
 
 
334 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  31.08 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  32.39 
 
 
352 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.38 
 
 
335 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.26 
 
 
341 aa  152  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.61 
 
 
335 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.94 
 
 
325 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.91 
 
 
335 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  33.98 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  26.04 
 
 
355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.08 
 
 
345 aa  146  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  30.21 
 
 
357 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  30.36 
 
 
351 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  30.36 
 
 
351 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  30.36 
 
 
351 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  32.56 
 
 
352 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.36 
 
 
352 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  29.14 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  28.31 
 
 
351 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.85 
 
 
332 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  27.99 
 
 
339 aa  136  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  29.64 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  31.04 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  29.14 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  28.21 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  30.03 
 
 
346 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  30.03 
 
 
346 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.49 
 
 
509 aa  123  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  25.93 
 
 
376 aa  109  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.4 
 
 
531 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  24.76 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2167  TrkA-N domain protein  26.84 
 
 
232 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  24.48 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  31.73 
 
 
662 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.85 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  24.14 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  26.77 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  23.71 
 
 
397 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.43 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  30.8 
 
 
549 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  25.68 
 
 
771 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  24.77 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  28.38 
 
 
393 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  27.07 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 
548 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  33.53 
 
 
182 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.14 
 
 
395 aa  86.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  25.74 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.23 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  28.16 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  24.92 
 
 
544 aa  82.8  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.26 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  27.27 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  24.89 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  28.24 
 
 
544 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>