More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2518 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  100 
 
 
362 aa  731    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  75.35 
 
 
354 aa  541  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  73.37 
 
 
338 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  67.33 
 
 
355 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  65.82 
 
 
356 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  65.82 
 
 
356 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  56.21 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  41.21 
 
 
350 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  41.21 
 
 
351 aa  248  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  40.76 
 
 
351 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  41.46 
 
 
350 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  41.46 
 
 
350 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  37.73 
 
 
350 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  37.81 
 
 
332 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  41.43 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  42.77 
 
 
359 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  41.36 
 
 
351 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  38.1 
 
 
337 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  36.28 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  37.1 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  38.36 
 
 
331 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  41.36 
 
 
352 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  34.81 
 
 
371 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  37.61 
 
 
351 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  37.61 
 
 
351 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  31.83 
 
 
335 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  31.83 
 
 
335 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  37.61 
 
 
351 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  37.06 
 
 
346 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  33.87 
 
 
335 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  31.83 
 
 
335 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  38.32 
 
 
346 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  34.27 
 
 
336 aa  202  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  38.32 
 
 
346 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  36.39 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  32.41 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  34.91 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  33.55 
 
 
325 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  32.21 
 
 
330 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  35.03 
 
 
350 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  31.19 
 
 
333 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  31.9 
 
 
330 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  32.83 
 
 
332 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.82 
 
 
330 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  35.07 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.02 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  28.7 
 
 
346 aa  183  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  32.23 
 
 
332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  32.34 
 
 
330 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  31.9 
 
 
334 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  31.9 
 
 
330 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  31.9 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  31.99 
 
 
345 aa  180  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  35.69 
 
 
341 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  31.72 
 
 
384 aa  170  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  33.44 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  30.03 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  29.94 
 
 
355 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  29.7 
 
 
339 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  31.8 
 
 
337 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  30.47 
 
 
346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  32.56 
 
 
509 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  31.56 
 
 
357 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  26.8 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  30.96 
 
 
347 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  27.05 
 
 
376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  26.32 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
324 aa  126  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  24.7 
 
 
376 aa  119  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.28 
 
 
366 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  25.37 
 
 
376 aa  117  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  34.83 
 
 
182 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  29.24 
 
 
256 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  23.22 
 
 
378 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  29.37 
 
 
395 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 
531 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30 
 
 
388 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  22.84 
 
 
375 aa  103  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 
564 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  28 
 
 
350 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  26.61 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  26.61 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  27.85 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  26.61 
 
 
417 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  26.61 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  26.61 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  26.61 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  26.61 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  26.61 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  26.61 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  31.39 
 
 
215 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  27.34 
 
 
564 aa  90.1  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  26.13 
 
 
347 aa  90.1  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  32.02 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  25 
 
 
368 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2167  TrkA-N domain protein  23.32 
 
 
232 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 
662 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  27 
 
 
668 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 
673 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  28.89 
 
 
366 aa  86.3  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>