More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5545 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 341 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  38.94 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  36.39 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  35.38 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  39.61 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  36.09 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  36.94 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  34.26 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  34.15 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  33.53 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  39.74 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 		 346 aa  215  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  35.51 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  37.65 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  34.15 
 
 		 350 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  38.41 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  31.52 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  31.52 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  31.21 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  32.28 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  33.64 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  33.43 
 
 		 330 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  33.43 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.13 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  33.43 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  33.43 
 
 		 330 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  32.74 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  30.96 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  34.93 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  31.17 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  33.12 
 
 		 354 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  36.67 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  35.69 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  33.23 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  35.62 
 
 		 355 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  35.28 
 
 		 384 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  26.77 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  33.66 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  32 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  32.31 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  35.9 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.38 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  35.58 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  31.21 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  32.92 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  33.54 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  29.91 
 
 		 357 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  37.97 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  30.22 
 
 		 339 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  33.74 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  29.11 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  29.11 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  35.8 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  29.11 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  32.7 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  35.86 
 
 		 346 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  32.93 
 
 		 351 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  33.02 
 
 		 359 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  30.82 
 
 		 337 aa  143  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  32.62 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  27.02 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  29.04 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.69 
 
 		 397 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  34.58 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  26.77 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  37.81 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  34.1 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  23.78 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  24.52 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.04 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  28.15 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 413 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  28.15 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  28.15 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  27.97 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  27.81 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  37.5 
 
 		 146 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  27.81 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  27.81 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  27.81 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  24.92 
 
 		 531 aa  102  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  26.37 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  26.37 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  27.61 
 
 		 364 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.78 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  27.44 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  31.86 
 
 		 399 aa  99.8  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  22.29 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  25.58 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 256 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  28.39 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  29.23 
 
 		 546 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>