More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2971 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
350 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  73.43 
 
 
351 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  71.06 
 
 
351 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  70.48 
 
 
350 aa  488  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  67.33 
 
 
350 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  67.33 
 
 
350 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  58.05 
 
 
337 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  44.65 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  43.21 
 
 
346 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  44.65 
 
 
371 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  44.06 
 
 
347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  43.25 
 
 
333 aa  286  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  43.67 
 
 
331 aa  278  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  41.39 
 
 
350 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  41.36 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  38.67 
 
 
354 aa  249  4e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  38.12 
 
 
356 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  38.12 
 
 
356 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  41.19 
 
 
330 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  41.23 
 
 
350 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  37.88 
 
 
338 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  37.73 
 
 
362 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  36.89 
 
 
355 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  38.84 
 
 
330 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  38.84 
 
 
330 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  38.23 
 
 
334 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  38.53 
 
 
334 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  37.92 
 
 
330 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  38.23 
 
 
330 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  39.38 
 
 
337 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  36.31 
 
 
335 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  36.8 
 
 
341 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 
335 aa  222  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  36.01 
 
 
335 aa  222  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  34.12 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  34.26 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  34.64 
 
 
346 aa  218  8.999999999999998e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  41.25 
 
 
341 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  36.06 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  38.18 
 
 
384 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  38.65 
 
 
335 aa  216  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  35.2 
 
 
337 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  35.17 
 
 
345 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  35.35 
 
 
332 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  35.65 
 
 
332 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  36.14 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  36.06 
 
 
355 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  35.09 
 
 
346 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  33.65 
 
 
325 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  30.24 
 
 
352 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  33.24 
 
 
352 aa  179  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  32.46 
 
 
509 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  32.84 
 
 
351 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  31.07 
 
 
357 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  34.67 
 
 
347 aa  175  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  31.4 
 
 
359 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  33.23 
 
 
366 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  31.99 
 
 
339 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  31.99 
 
 
352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  31.58 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  31.96 
 
 
351 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  31.96 
 
 
351 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  31.96 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  32.37 
 
 
346 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  32.37 
 
 
346 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  30.4 
 
 
397 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  28.53 
 
 
378 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  26.98 
 
 
324 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  28.1 
 
 
376 aa  143  6e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  34.8 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25.72 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  25.9 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  31.39 
 
 
256 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  36.93 
 
 
182 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  34.51 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  28.66 
 
 
531 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  24.92 
 
 
376 aa  119  7e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  34.45 
 
 
395 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 
393 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  40.58 
 
 
146 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  29.1 
 
 
650 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  31.95 
 
 
252 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.38 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  28.82 
 
 
251 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  26.23 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  26.94 
 
 
368 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  25.09 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.68 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  24.62 
 
 
546 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  26.69 
 
 
544 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  27.1 
 
 
541 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  26.89 
 
 
542 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  23.78 
 
 
517 aa  90.9  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  31.29 
 
 
564 aa  90.5  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  23.68 
 
 
575 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  23.37 
 
 
386 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  23.29 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  23.29 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  26.4 
 
 
341 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>