More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1751 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  94.58 
 
 
332 aa  636    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
332 aa  664    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  42.99 
 
 
339 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  42.07 
 
 
346 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  39.7 
 
 
330 aa  241  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  39.14 
 
 
330 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  39.14 
 
 
334 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  39.14 
 
 
334 aa  228  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  39.14 
 
 
330 aa  228  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  38.84 
 
 
330 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  38.23 
 
 
330 aa  225  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  37.43 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  37.22 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  36.56 
 
 
332 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  34.94 
 
 
354 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  34.64 
 
 
355 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  33.86 
 
 
324 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  35.53 
 
 
356 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  35.85 
 
 
356 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  37.3 
 
 
331 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  35.65 
 
 
350 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  33.23 
 
 
350 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  34.57 
 
 
338 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 
346 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  35.17 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  35.56 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  31.63 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  32.71 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  34.69 
 
 
347 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  33.74 
 
 
351 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  32.83 
 
 
355 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  34.06 
 
 
337 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  33.13 
 
 
371 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  34.47 
 
 
350 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  32.83 
 
 
362 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  33.54 
 
 
346 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  31.83 
 
 
335 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  31.21 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 
335 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  32.63 
 
 
337 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 
335 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  30.7 
 
 
335 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 
336 aa  179  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  38.14 
 
 
341 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  32.69 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  31.56 
 
 
352 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  33.99 
 
 
352 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  29.77 
 
 
341 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  31.99 
 
 
352 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  32.31 
 
 
341 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  32.19 
 
 
357 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  31.94 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  29.41 
 
 
351 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  29.41 
 
 
351 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  31.06 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  29.41 
 
 
351 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  32.3 
 
 
351 aa  159  9e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  29.75 
 
 
346 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  29.75 
 
 
346 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  32.64 
 
 
345 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 
509 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  31.55 
 
 
347 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  29.14 
 
 
368 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.52 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  29.36 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  30.67 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  40 
 
 
182 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  30.16 
 
 
668 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.63 
 
 
531 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  26.91 
 
 
652 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  28.69 
 
 
693 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 
665 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  40.15 
 
 
146 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 
544 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 
544 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 
771 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  31.36 
 
 
567 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  32.3 
 
 
225 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.09 
 
 
376 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  28.82 
 
 
366 aa  99.8  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.52 
 
 
395 aa  99.4  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.11 
 
 
388 aa  99.4  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  27.24 
 
 
673 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  30.04 
 
 
542 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  28.05 
 
 
671 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 
674 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  25.24 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  28.51 
 
 
402 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  28.51 
 
 
402 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  28.69 
 
 
417 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  28.69 
 
 
417 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  28.69 
 
 
417 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  28.69 
 
 
417 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  28.69 
 
 
417 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  28.69 
 
 
417 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.52 
 
 
671 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  27.56 
 
 
773 aa  95.9  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 
636 aa  95.9  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  24.01 
 
 
335 aa  95.9  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>