More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1968 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 544 aa  1070    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  53.22 
 
 		 544 aa  568  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  48.14 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  43.49 
 
 		 548 aa  431  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  42.86 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  33.88 
 
 		 562 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  33.02 
 
 		 551 aa  259  8e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  30.94 
 
 		 567 aa  250  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  29.62 
 
 		 564 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  27.85 
 
 		 569 aa  208  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  27.8 
 
 		 568 aa  207  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  27.92 
 
 		 567 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  32.18 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  28.73 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  25.81 
 
 		 614 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  28.62 
 
 		 576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  34.29 
 
 		 293 aa  143  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  23.77 
 
 		 568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  27.47 
 
 		 347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  35.16 
 
 		 225 aa  120  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  29.25 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  32.82 
 
 		 350 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  28.91 
 
 		 332 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.5 
 
 		 332 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.69 
 
 		 350 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  29.21 
 
 		 355 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.7 
 
 		 336 aa  89.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  30.23 
 
 		 366 aa  90.1  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  26.4 
 
 		 351 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  26.4 
 
 		 351 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 350 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  26.4 
 
 		 351 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 		 351 aa  87.8  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 325 aa  87.4  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 335 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  25.16 
 
 		 350 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  23.58 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  25.16 
 
 		 350 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  31.44 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  27.75 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.05 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.69 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  24.43 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  30.8 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  24.23 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  27.4 
 
 		 352 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  26.22 
 
 		 351 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 		 350 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  28.44 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  27.06 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  24.68 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  23.85 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.12 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  28 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30.43 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.21 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  24.68 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.61 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.73 
 
 		 334 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  23.81 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  23.39 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  28.14 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  24.27 
 
 		 206 aa  79.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.39 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.65 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  24.32 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25.68 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  23.76 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.39 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.96 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 668 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  25.88 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  32.29 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  25.76 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  28.24 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  26.27 
 
 		 673 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  23.94 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  23.94 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  26.39 
 
 		 219 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 		 395 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  21.52 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25.74 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.78 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  25.47 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  25.47 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  27.88 
 
 		 652 aa  70.5  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.52 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  28.31 
 
 		 331 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  35.94 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  25.24 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  27.01 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  25.94 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  37.8 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  26.53 
 
 		 666 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  21.67 
 
 		 337 aa  67  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  26.79 
 
 		 227 aa  67  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>