More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0899 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 567 aa  1154    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  44.01 
 
 		 568 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  42.96 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  41.41 
 
 		 614 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  38.87 
 
 		 564 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  35.65 
 
 		 576 aa  340  4e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 		 544 aa  250  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 		 542 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  28.52 
 
 		 544 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  29.4 
 
 		 562 aa  203  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  30.19 
 
 		 569 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  28.25 
 
 		 541 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  25.31 
 
 		 548 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  24.91 
 
 		 549 aa  150  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  30.6 
 
 		 347 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  24.02 
 
 		 551 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  21.43 
 
 		 568 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  31.36 
 
 		 332 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  28.18 
 
 		 332 aa  99.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  29.86 
 
 		 330 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  22.26 
 
 		 313 aa  96.3  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  29.18 
 
 		 337 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  29.6 
 
 		 225 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  31.58 
 
 		 293 aa  94.7  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  28.33 
 
 		 334 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  28.33 
 
 		 334 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 		 330 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 330 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  27.9 
 
 		 330 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  27.9 
 
 		 330 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.38 
 
 		 332 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25.5 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  29.55 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 325 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  32.86 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.63 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  26.9 
 
 		 206 aa  82.4  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  24.38 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.11 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  29.67 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  27.34 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  27.73 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.42 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  21.54 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.52 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.76 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  23.93 
 
 		 338 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  25.21 
 
 		 668 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.09 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  19.76 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.12 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  26.48 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.34 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  28.71 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  26.48 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  26.48 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  24.02 
 
 		 324 aa  73.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.81 
 
 		 663 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.29 
 
 		 352 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  34.96 
 
 		 393 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  27.55 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2167  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 		 232 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  23.32 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  24.43 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  26.51 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.03 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.52 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  23.48 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.35 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.8 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  23.58 
 
 		 366 aa  67  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 		 335 aa  67  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  24.26 
 
 		 346 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  30.22 
 
 		 391 aa  67  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  22.54 
 
 		 362 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  24.1 
 
 		 214 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  24.15 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  24.77 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  24.35 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  30.22 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  29.5 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  30.22 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.68 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.86 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  28.71 
 
 		 661 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  25.25 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.06 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  26.91 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  29.49 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  35.45 
 
 		 654 aa  64.3  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  23.65 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  27.52 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  25.35 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  32.8 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>