138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3784 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  100 
 
 		 341 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02186  voltage-gated ion channel superfamily protein  37.76 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  35.8 
 
 		 344 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  35.4 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  31.78 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  30.88 
 
 		 349 aa  185  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  31.2 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  31.2 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  31.9 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  28.04 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  29.74 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  29.55 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.97 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  25.36 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  24.41 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  25.55 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  24.84 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  25 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  26.1 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  25.61 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  26.42 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  25.81 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  25.81 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  25.16 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  25.61 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  25.62 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  25.16 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  25.16 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  25.16 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  25.16 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  25.48 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  26.86 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  25.24 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  25.16 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  26.47 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  23.13 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  26.25 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  23.49 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0551  Ion transport 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  22.76 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  25.23 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  23.5 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  25 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  26.84 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  25.23 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  25.23 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0460  Ion transport 2 domain-containing protein  25.23 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.44 
 
 		 388 aa  57  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  26.99 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  26.99 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  26.01 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.89 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  27.63 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  26.01 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  27.19 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  27.19 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  24.02 
 
 		 386 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  24.68 
 
 		 531 aa  53.5  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  27.19 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  25.16 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  27.19 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  27.19 
 
 		 417 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  27.19 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  27.19 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  24.92 
 
 		 337 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  24.02 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  24.02 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  24.02 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  26.9 
 
 		 576 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.96 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  24.46 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  25.3 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  24.86 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  28.07 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  24.46 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  22.91 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  24.31 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  27.19 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.15 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  23.76 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  23.76 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  25.2 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  23.57 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  23.76 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  23.76 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  23.76 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  23.76 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  23.76 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  23.76 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  37.68 
 
 		 265 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>