291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1890 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  99.5 
 
 		 417 aa  805    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  99.25 
 
 		 417 aa  802    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  99.5 
 
 		 417 aa  805    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  99.5 
 
 		 417 aa  805    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  99.5 
 
 		 417 aa  805    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  99.25 
 
 		 417 aa  804    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  99.75 
 
 		 402 aa  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  100 
 
 		 402 aa  810    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  99.25 
 
 		 417 aa  803    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  40.4 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  40.4 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  40.16 
 
 		 416 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  40.3 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  40.3 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  40.3 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  39.64 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  39.09 
 
 		 391 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  39.64 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  39.64 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  38.92 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  38.62 
 
 		 408 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  39.17 
 
 		 438 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.56 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30.5 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.4 
 
 		 395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.4 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.99 
 
 		 325 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.99 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.21 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  28.69 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.68 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 		 335 aa  93.6  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  29.51 
 
 		 531 aa  93.6  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 		 335 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 330 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.09 
 
 		 347 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 331 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25.1 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  26.61 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.78 
 
 		 330 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  24.67 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 		 509 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.67 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  24.67 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  27.43 
 
 		 336 aa  88.2  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  24.67 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.11 
 
 		 330 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.55 
 
 		 337 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  25.13 
 
 		 351 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  25.13 
 
 		 351 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  24.79 
 
 		 338 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  24.79 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.03 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.62 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  25.32 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.1 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.1 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  28.57 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.71 
 
 		 355 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  24.53 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.3 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  27.66 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.27 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  22.97 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.1 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  22.12 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.26 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  26.38 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  23.24 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  25.31 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  28.34 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  24.7 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  23.5 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  26.32 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.8 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  22.51 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.92 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.07 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  24.11 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  22.08 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.39 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  25.35 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  22.77 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  23.71 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  23.3 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  24.45 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  24.45 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  24 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  26.2 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  23.56 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  24.05 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>