119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2744 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
363 aa  724    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  29.01 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  29.68 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  24.3 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  22.02 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  27.16 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  27.2 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  22.68 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  25.96 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  24.73 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  23.99 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  26.79 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  28.96 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  25.83 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  28.65 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  25.97 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  22.46 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  27.24 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0551  Ion transport 2 domain-containing protein  23.19 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43127  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  27.23 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0775  Ion transport 2 domain-containing protein  21.27 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  25.82 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  25.67 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  25.67 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  25.67 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  21.71 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  25.67 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  26.09 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
341 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0460  Ion transport 2 domain-containing protein  24.69 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  25.95 
 
 
331 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  24.36 
 
 
393 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  22.67 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  28.22 
 
 
272 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  23.5 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  25 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  25.1 
 
 
356 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  22.88 
 
 
359 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  22.88 
 
 
359 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  22.88 
 
 
359 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  25.57 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  24.3 
 
 
341 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  22.88 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  22.46 
 
 
345 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  23.14 
 
 
359 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
355 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  25.99 
 
 
336 aa  49.7  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  32.26 
 
 
269 aa  49.7  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  36.76 
 
 
231 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  23.3 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  28.97 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  26.25 
 
 
241 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  32 
 
 
228 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  24.12 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  30.84 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  23.17 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  23.01 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  22.71 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  27.43 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  42.59 
 
 
271 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  27.15 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  31.52 
 
 
269 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  25.69 
 
 
253 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  31.46 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  42.05 
 
 
268 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  30.34 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
268 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  22.8 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0900  Ion transport 2 domain protein  21.19 
 
 
264 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.283884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  29.79 
 
 
274 aa  47  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  39.74 
 
 
509 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  24.11 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  24.11 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  22.47 
 
 
333 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  23.9 
 
 
364 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  24.11 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  30.09 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  38.46 
 
 
268 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  24.11 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  26.39 
 
 
948 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1169  hypothetical protein  33.68 
 
 
251 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242801  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  27.96 
 
 
517 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  30.56 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  23.51 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  35.09 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  29.91 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  29.09 
 
 
265 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0706  hypothetical protein  35 
 
 
114 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  47.62 
 
 
135 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  35.09 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  35.09 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  27.96 
 
 
269 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  23.6 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4630  hypothetical protein  34 
 
 
114 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696227  hitchhiker  0.00000000000143872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>