More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 		 576 aa  1132    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  38.74 
 
 		 567 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  37.52 
 
 		 614 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  39.67 
 
 		 568 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  35.65 
 
 		 567 aa  340  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  33.15 
 
 		 564 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  27.87 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  29.31 
 
 		 569 aa  151  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  30.9 
 
 		 544 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  28.62 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  28.32 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  28.09 
 
 		 541 aa  134  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  25.87 
 
 		 562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 		 548 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  27.99 
 
 		 347 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  26.5 
 
 		 549 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 		 325 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  23.36 
 
 		 568 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  25.43 
 
 		 551 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.96 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.02 
 
 		 350 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.02 
 
 		 350 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25.3 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.76 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25.15 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.45 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.45 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  23.67 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.45 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  40.5 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.91 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.39 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.17 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  28 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  24.17 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.27 
 
 		 335 aa  72  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  27.35 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.7 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.61 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.15 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.09 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  24.51 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  24.48 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.78 
 
 		 359 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.17 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  23.53 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  23.59 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.11 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  22.5 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.4 
 
 		 351 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  29.79 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  24.69 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.91 
 
 		 682 aa  67  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  35.34 
 
 		 661 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  29.63 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  23.98 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  23.81 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.1 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  30.07 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  35.34 
 
 		 661 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  27.23 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  25.51 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.17 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  23.87 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  23.87 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.4 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  34.4 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  32.54 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.53 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  31.11 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  28.79 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  20.85 
 
 		 313 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  24.36 
 
 		 350 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.58 
 
 		 588 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  43.68 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  37.19 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.12 
 
 		 663 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  26.67 
 
 		 338 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  31.58 
 
 		 337 aa  62  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 		 356 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  23.6 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  35.14 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  26.91 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  33.58 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 661 aa  60.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.46 
 
 		 648 aa  60.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 		 656 aa  60.5  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  30.59 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 		 584 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 		 649 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 		 661 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.52 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  23.2 
 
 		 356 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  27.98 
 
 		 364 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>