More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0396 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 457 aa  925    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 569 aa  224  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  41.01 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  32.53 
 
 		 542 aa  209  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  33.48 
 
 		 549 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 		 544 aa  205  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  30.89 
 
 		 564 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 		 567 aa  196  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  32.18 
 
 		 544 aa  187  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  31.61 
 
 		 562 aa  179  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  30.57 
 
 		 548 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  32.22 
 
 		 541 aa  170  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 		 568 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  29.28 
 
 		 567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  28.32 
 
 		 576 aa  150  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  25.97 
 
 		 568 aa  143  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  26.68 
 
 		 614 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  46.22 
 
 		 225 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  23.93 
 
 		 551 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  33.66 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  26.8 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.97 
 
 		 332 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.39 
 
 		 330 aa  97.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.46 
 
 		 334 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.46 
 
 		 334 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.46 
 
 		 330 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.71 
 
 		 330 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.32 
 
 		 337 aa  94  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 388 aa  93.2  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  24.58 
 
 		 330 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  33.68 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  27.09 
 
 		 350 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  23.95 
 
 		 341 aa  89  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  29.54 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  22.65 
 
 		 335 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  22.94 
 
 		 335 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  25.37 
 
 		 345 aa  86.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  24.93 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  26.25 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  23.47 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  25.25 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  31.88 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  33.61 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.17 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.35 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  33.86 
 
 		 350 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.24 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  33.86 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  33.86 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  30.71 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  25.85 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.18 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  30.35 
 
 		 293 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  24.15 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  25.5 
 
 		 339 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  27.95 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  25.91 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  23.76 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  32.09 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25.76 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  35.2 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  33.33 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  26.76 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  23.43 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  23.8 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.46 
 
 		 588 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  25.97 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  35.25 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.31 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.58 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.58 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  25.73 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  28.22 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  29.05 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  31.1 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  25.73 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  31.1 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  29.05 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.04 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  32.7 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  30.88 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  26.56 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  35.34 
 
 		 584 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  26.16 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.25 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  26.16 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  26.16 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  26.16 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  26.16 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  26.16 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.91 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  26.82 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  26.82 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  26.82 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  26.16 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.5 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>