111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2072 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  100 
 
 		 568 aa  1163    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  30.92 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  29.66 
 
 		 549 aa  259  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  24.25 
 
 		 544 aa  153  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  24.82 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  25.97 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  23.77 
 
 		 544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  23.56 
 
 		 548 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  24.91 
 
 		 541 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  22.5 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  22.65 
 
 		 564 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  21.43 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  22.81 
 
 		 567 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  21.9 
 
 		 568 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  23.35 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  22.88 
 
 		 551 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  26.57 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  23.58 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  20.36 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.34 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  21.1 
 
 		 341 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.26 
 
 		 371 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  21.24 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  25.58 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  28 
 
 		 225 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  21.18 
 
 		 330 aa  55.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  23.46 
 
 		 336 aa  54.7  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  24.36 
 
 		 395 aa  53.9  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  28.79 
 
 		 346 aa  53.5  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.17 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.92 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.17 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  24.31 
 
 		 346 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  30.15 
 
 		 256 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 368 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  30.37 
 
 		 346 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  22.28 
 
 		 749 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.17 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  22.13 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 		 350 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  22.13 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  23.18 
 
 		 393 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  22.13 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  22.13 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  20.6 
 
 		 334 aa  51.6  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  20.6 
 
 		 334 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  28.1 
 
 		 366 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  24.66 
 
 		 351 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  22.13 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  22.13 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  22.13 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  20.6 
 
 		 330 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  22.13 
 
 		 417 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 341 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  24.11 
 
 		 355 aa  51.2  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  29.57 
 
 		 352 aa  50.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.15 
 
 		 347 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  24.31 
 
 		 347 aa  50.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 		 331 aa  50.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  20.73 
 
 		 356 aa  50.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3513  potassium efflux system protein  24.86 
 
 		 602 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.47 
 
 		 384 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  25.82 
 
 		 206 aa  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.33 
 
 		 332 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.05 
 
 		 335 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  21.7 
 
 		 417 aa  49.7  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  22.05 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  27.65 
 
 		 362 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  23.94 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  25 
 
 		 351 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  26.17 
 
 		 357 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  21.3 
 
 		 337 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.5 
 
 		 655 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  25.71 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  21.8 
 
 		 330 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  21.8 
 
 		 330 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  23.08 
 
 		 335 aa  47.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 		 333 aa  47.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  22.84 
 
 		 564 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  21.68 
 
 		 345 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  24.11 
 
 		 233 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  27.93 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  21.68 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  23.65 
 
 		 336 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 		 569 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  25 
 
 		 457 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.21 
 
 		 335 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.21 
 
 		 335 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  20.85 
 
 		 330 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1436  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 		 614 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  22.71 
 
 		 355 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  23.87 
 
 		 346 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  22.22 
 
 		 344 aa  45.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  26.77 
 
 		 345 aa  44.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  23.48 
 
 		 636 aa  44.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  23.53 
 
 		 359 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 531 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  23.37 
 
 		 397 aa  44.3  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>