More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3112 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  100 
 
 
225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  35.16 
 
 
544 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  34.56 
 
 
542 aa  118  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  32.57 
 
 
544 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  34.48 
 
 
541 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  46.22 
 
 
457 aa  106  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  32.56 
 
 
549 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  32.59 
 
 
332 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 
332 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  34.08 
 
 
330 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.45 
 
 
341 aa  96.3  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  34.08 
 
 
334 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  34.08 
 
 
330 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  29.6 
 
 
567 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  34.08 
 
 
334 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  33.94 
 
 
330 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  30.32 
 
 
548 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  40 
 
 
569 aa  92.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.32 
 
 
330 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  30.67 
 
 
564 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.29 
 
 
330 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.56 
 
 
325 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  27.9 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  33.04 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.46 
 
 
663 aa  82  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.11 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.11 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.11 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  35.61 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  25.41 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  24.78 
 
 
335 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  28.57 
 
 
567 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.89 
 
 
384 aa  78.6  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.55 
 
 
351 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  26.22 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  28.94 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.38 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  36.03 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  23.64 
 
 
568 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  37.6 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.07 
 
 
371 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  25.97 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.09 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.01 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.07 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.07 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  28.95 
 
 
355 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 
614 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  35.03 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  25.99 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  25.32 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  24.36 
 
 
674 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  34.29 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.78 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  25.99 
 
 
562 aa  72.4  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  27.35 
 
 
576 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
662 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  30.68 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  25.2 
 
 
771 aa  70.1  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  26.53 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 
671 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  35.16 
 
 
345 aa  68.9  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  26.34 
 
 
350 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2167  TrkA-N domain protein  23.45 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.43 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  28.4 
 
 
350 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.83 
 
 
346 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  33.9 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  34.65 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  23.14 
 
 
671 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  26.56 
 
 
673 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.33 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.64 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  23.79 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  28.78 
 
 
346 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  23.97 
 
 
668 aa  65.1  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  24.66 
 
 
352 aa  65.1  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 
775 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.24 
 
 
350 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  32.28 
 
 
393 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.89 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  28.78 
 
 
346 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.89 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.58 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  23.21 
 
 
359 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.89 
 
 
351 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  22.58 
 
 
762 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  29.37 
 
 
362 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  30.83 
 
 
370 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 
366 aa  62.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  25.52 
 
 
346 aa  62  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
359 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  31.11 
 
 
555 aa  62  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  28.48 
 
 
355 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.79 
 
 
332 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  31.21 
 
 
613 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>