More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1635 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  62.17 
 
 		 568 aa  721    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 567 aa  1158    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  51.24 
 
 		 614 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  42.96 
 
 		 567 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  40.19 
 
 		 576 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  35.52 
 
 		 564 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  28.06 
 
 		 542 aa  226  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  28.94 
 
 		 544 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  28.12 
 
 		 544 aa  208  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  26.31 
 
 		 562 aa  189  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  28.49 
 
 		 541 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  25.09 
 
 		 569 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  29.28 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  26.02 
 
 		 548 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  25.86 
 
 		 549 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  27.9 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  23.16 
 
 		 568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  22.08 
 
 		 551 aa  102  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 		 336 aa  93.2  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 		 325 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  33.53 
 
 		 206 aa  88.2  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  28.79 
 
 		 337 aa  87.8  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.13 
 
 		 332 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 		 335 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  27.8 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  25.37 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 335 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 332 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  28.18 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  28.32 
 
 		 350 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.75 
 
 		 384 aa  76.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  23.83 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.48 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.73 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.3 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.33 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  27.24 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.27 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.27 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  27.36 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  26.27 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.27 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.6 
 
 		 697 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.88 
 
 		 330 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.13 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  20.61 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  20.92 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  20.92 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  20.92 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  27.49 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  20.31 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  21.04 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  21.65 
 
 		 356 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  21.65 
 
 		 356 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  25.77 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  22.61 
 
 		 672 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  27.15 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  19.51 
 
 		 338 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  24.7 
 
 		 337 aa  66.6  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  21.97 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  28.83 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  28.8 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  28.8 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  24.09 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  24.79 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  29.49 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  24.67 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  23.5 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  25.2 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.09 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  28.26 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  25.46 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  23.83 
 
 		 351 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  25.71 
 
 		 221 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 		 331 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  25.48 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  24.58 
 
 		 668 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  29.09 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  24.49 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  25.71 
 
 		 221 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  25.57 
 
 		 224 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 		 346 aa  62  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 		 220 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  29.14 
 
 		 575 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 		 656 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  25.94 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  26.16 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  27.2 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>