171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1315 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  100 
 
 
293 aa  577  1e-164  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  66.94 
 
 
562 aa  335  7e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  37.7 
 
 
544 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  42.53 
 
 
551 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  36.29 
 
 
542 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  34.29 
 
 
544 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  39.91 
 
 
541 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  37.02 
 
 
548 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  28.57 
 
 
347 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  31.58 
 
 
567 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 
341 aa  93.2  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 
350 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 
614 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.32 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  36.84 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.26 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  28.15 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.2 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  27.05 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  27.93 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  29.26 
 
 
564 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  28.77 
 
 
567 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 
568 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  30.35 
 
 
457 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.14 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  24.69 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  33.07 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  24.78 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  27.71 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  40.15 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  24.78 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  25.74 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  27.18 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.43 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  27.95 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  38.1 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.1 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  24.12 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  24.26 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  25.55 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  26.86 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25.65 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  23.53 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  32.6 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.78 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  24.78 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  28.16 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  26.11 
 
 
362 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  27.39 
 
 
569 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  37.09 
 
 
399 aa  63.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.14 
 
 
330 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.14 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  23.14 
 
 
330 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.14 
 
 
334 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  25.75 
 
 
352 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.22 
 
 
332 aa  62.4  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  23.14 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  22.61 
 
 
509 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  25.82 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  25 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.75 
 
 
352 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  23.5 
 
 
352 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  23.14 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  25.93 
 
 
384 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  24.09 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  22.18 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  27.37 
 
 
366 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  24.09 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  30.37 
 
 
368 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  25.12 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  21.77 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  22.83 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  31.47 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  26.02 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  29.01 
 
 
386 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  23.55 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  26.02 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  24.69 
 
 
359 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  27.85 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  22.08 
 
 
256 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  22.36 
 
 
378 aa  52.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  21.77 
 
 
376 aa  52.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  29.38 
 
 
366 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 
251 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  22.9 
 
 
658 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  20 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  26.5 
 
 
662 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  25.43 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  20 
 
 
351 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  20 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  25.52 
 
 
231 aa  49.7  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  27.48 
 
 
364 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>