229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1924 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  100 
 
 
551 aa  1082    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  43.33 
 
 
562 aa  405  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  36.8 
 
 
544 aa  298  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  34.2 
 
 
542 aa  293  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  34.93 
 
 
548 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  32.96 
 
 
544 aa  269  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  35.21 
 
 
541 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  42.53 
 
 
293 aa  172  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  24.78 
 
 
567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  25.55 
 
 
568 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  24.17 
 
 
569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
564 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  24.58 
 
 
614 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  24.34 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  23.43 
 
 
549 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  22.34 
 
 
567 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  27.78 
 
 
347 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  23.12 
 
 
568 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 
330 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  26.35 
 
 
335 aa  87.4  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  25.43 
 
 
576 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  24.75 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  25.75 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.3 
 
 
335 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  24.92 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.55 
 
 
341 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.55 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.22 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.55 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 
395 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  23.76 
 
 
330 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.76 
 
 
330 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  24.8 
 
 
350 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.63 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  23.15 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  22.95 
 
 
330 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  23.32 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  22.26 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.39 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  24.41 
 
 
335 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  22.66 
 
 
332 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  24.84 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  23.14 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  24.59 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  25.72 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  24.29 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  23.89 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  23.6 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  32.22 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.57 
 
 
352 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  22.76 
 
 
509 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.08 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  25.78 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.75 
 
 
345 aa  67  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.22 
 
 
352 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  20.51 
 
 
350 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  22.18 
 
 
335 aa  65.1  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  22.06 
 
 
357 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  23.48 
 
 
351 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  23.38 
 
 
324 aa  64.3  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  23.48 
 
 
351 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.48 
 
 
351 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  23.62 
 
 
333 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.44 
 
 
341 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 
364 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  22.93 
 
 
351 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  25.96 
 
 
393 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  26.44 
 
 
364 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  29.59 
 
 
344 aa  60.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  26.44 
 
 
386 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  26.92 
 
 
364 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 
364 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  23.75 
 
 
313 aa  60.1  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  22.82 
 
 
356 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  22.82 
 
 
356 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 
326 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  25.89 
 
 
225 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  28.5 
 
 
395 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
652 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  25.35 
 
 
326 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 
326 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  25.35 
 
 
326 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  25.82 
 
 
413 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  21.45 
 
 
350 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  25.96 
 
 
364 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 
369 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  27.33 
 
 
337 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  25.35 
 
 
369 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  25.96 
 
 
364 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  25.35 
 
 
369 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  31.43 
 
 
251 aa  57.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  26.79 
 
 
347 aa  57.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  21.45 
 
 
350 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  29.79 
 
 
355 aa  57  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3047  potassium efflux system protein  32.03 
 
 
623 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.864029  normal  0.194006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  25 
 
 
450 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>