More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1196 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 569 aa  1167    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  47.16 
 
 		 549 aa  490  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2072  TrkA-N  30.92 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.712567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  28.87 
 
 		 542 aa  210  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  27.85 
 
 		 544 aa  208  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  30.19 
 
 		 567 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  28.55 
 
 		 544 aa  200  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  28.82 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  27.29 
 
 		 564 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1187  TrkA-N domain protein  27.65 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 		 562 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  26.22 
 
 		 568 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1635  Ion transport 2 domain protein  24.4 
 
 		 567 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0302468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  24.6 
 
 		 614 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07220  K+ transport system, NAD-binding component  29.31 
 
 		 576 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1924  TrkA-C domain protein  23.97 
 
 		 551 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  25.76 
 
 		 347 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3112  potassium channel protein  40 
 
 		 225 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.700906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 		 351 aa  90.9  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  30.09 
 
 		 336 aa  90.5  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  27.27 
 
 		 351 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 		 333 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  34.31 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  28.05 
 
 		 354 aa  83.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  30.04 
 
 		 350 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  34.97 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 		 350 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  29.73 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.97 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.85 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 341 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  33.11 
 
 		 346 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  31.65 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  36.5 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  34.35 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  28.84 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  27.6 
 
 		 338 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  27.03 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  32.37 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  28.76 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  28.32 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  24.49 
 
 		 668 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  32.61 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  24.64 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0418  TrkA-N domain protein  37 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 		 332 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  34.35 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  26.43 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  21.61 
 
 		 335 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  26.39 
 
 		 388 aa  72  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  26.94 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  21.9 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  27.43 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  30.66 
 
 		 256 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  34.17 
 
 		 341 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  27.88 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  21.68 
 
 		 330 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  25.45 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  30.47 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.29 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  25.57 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  27.15 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  25.84 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  21.36 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  25.76 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  22.83 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  21.36 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  21.04 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  25.73 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  25.37 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  24.88 
 
 		 352 aa  67  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  28.67 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  27.96 
 
 		 337 aa  66.6  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  32.61 
 
 		 331 aa  66.6  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  24.41 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  21.8 
 
 		 324 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  23.94 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  23.94 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.91 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  27.71 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  23.26 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  28.28 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  23.94 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  23.6 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  20.49 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  27.07 
 
 		 564 aa  64.3  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1315  TrkA-N domain protein  27.39 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  21.89 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  25.21 
 
 		 326 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 		 573 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  25.21 
 
 		 326 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  25.21 
 
 		 326 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>