More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1854 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  99.55 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  58.49 
 
 		 215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  56.6 
 
 		 220 aa  262  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  54.46 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  55.09 
 
 		 217 aa  258  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  53.3 
 
 		 227 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  50.92 
 
 		 220 aa  234  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  50.93 
 
 		 217 aa  231  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  48.11 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  49.31 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  51.4 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  48.84 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  48.84 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  49.29 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  47.25 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  46.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  46.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  46.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  46.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  46.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  46.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  46.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  46.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  46.79 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  46.33 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  43.46 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  47.17 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  41.59 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  45.5 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  41.59 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  41.86 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  40.65 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  42.99 
 
 		 223 aa  187  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  38.03 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  38.86 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  43.46 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  37.91 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  40.47 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  40.55 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  41.59 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  45.19 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  41.67 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  39.91 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  42.18 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  42.79 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  38.86 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  37.96 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  40.28 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  39.25 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  41.04 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  36.89 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  40.8 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  38.57 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  37.32 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  38.39 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  39.91 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  38.5 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  33.95 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  40.4 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  37.32 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  38.79 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  38.86 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  38.86 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  38.86 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  40.8 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  39.02 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  40.76 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  36.97 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  38.36 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  36.92 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  39.34 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  36.92 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  41.9 
 
 		 231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  37.5 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  37.5 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  37.91 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  36.92 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  36.28 
 
 		 234 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  37.44 
 
 		 232 aa  147  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  36.28 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  35.81 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  37.91 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00941  VIC family potassium channel protein  35.51 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  35.98 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  35.98 
 
 		 234 aa  144  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  35.35 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  36.23 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  33.95 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  37.74 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  34.12 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  37.79 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  34.29 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  33.63 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>